More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2965 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  55.37 
 
 		 594 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  58.66 
 
 		 594 aa  699    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  54.45 
 
 		 594 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 		 599 aa  1222    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  52.8 
 
 		 624 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  56.02 
 
 		 593 aa  668    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  74.67 
 
 		 600 aa  921    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  55.56 
 
 		 607 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  56.69 
 
 		 593 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  54.92 
 
 		 594 aa  627  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  52.71 
 
 		 609 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  53.87 
 
 		 592 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  54.97 
 
 		 597 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  52.4 
 
 		 601 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  51.88 
 
 		 613 aa  588  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  51.85 
 
 		 616 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  50.57 
 
 		 615 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  52.61 
 
 		 612 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  50.58 
 
 		 601 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  35.05 
 
 		 642 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  34.45 
 
 		 570 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  34.63 
 
 		 570 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  34.45 
 
 		 570 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  33.28 
 
 		 545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  34.45 
 
 		 570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  33.93 
 
 		 570 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  33.44 
 
 		 570 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  33.44 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  33.44 
 
 		 570 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  32.68 
 
 		 568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  32.73 
 
 		 564 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  33.45 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  31.6 
 
 		 565 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  32.92 
 
 		 590 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  31.57 
 
 		 643 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  33.51 
 
 		 573 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  33.62 
 
 		 630 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  33.55 
 
 		 586 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  32.69 
 
 		 593 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  31.62 
 
 		 563 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  33.73 
 
 		 562 aa  250  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  31.56 
 
 		 579 aa  246  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  32.32 
 
 		 553 aa  237  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4426  gamma-glutamyltransferase  31.42 
 
 		 601 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  32.93 
 
 		 543 aa  230  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  30.23 
 
 		 565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  30.71 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  29.46 
 
 		 561 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.32 
 
 		 536 aa  210  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  30.27 
 
 		 534 aa  204  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  31.87 
 
 		 536 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  30.11 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  34.11 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3760  gamma-glutamyltransferase  31.25 
 
 		 620 aa  200  7e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1566  gamma-glutamyltransferase  28.34 
 
 		 590 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.830668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  28.17 
 
 		 586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  28.26 
 
 		 583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  27.47 
 
 		 587 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0660  gamma-glutamyltransferase  29.79 
 
 		 580 aa  198  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3445  gamma-glutamyltransferase  29.51 
 
 		 581 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14390  gamma-glutamyltransferase 1  32.44 
 
 		 612 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  30.35 
 
 		 529 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04350  lincomycin-condensing protein lmbA, putative  27.7 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00329151  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  34.5 
 
 		 542 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3922  gamma-glutamyltranspeptidase  27.56 
 
 		 580 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.610979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1929  gamma-glutamyltransferase  27.27 
 
 		 581 aa  193  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.127563  normal  0.166463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  27.6 
 
 		 592 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4601  gamma-glutamyltransferase  28.43 
 
 		 583 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00594681  normal  0.046207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  27.6 
 
 		 597 aa  192  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03296  gamma-glutamyltranspeptidase periplasmic precursor  27.62 
 
 		 580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03249  hypothetical protein  27.62 
 
 		 580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.092805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4137  gamma-glutamyltransferase  28.26 
 
 		 583 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  28.38 
 
 		 576 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  30.09 
 
 		 534 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0269  gamma-glutamyltranspeptidase  27.62 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00159627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3644  gamma-glutamyltranspeptidase  27.62 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3863  gamma-glutamyltranspeptidase  27.2 
 
 		 580 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  27.94 
 
 		 587 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0268  gamma-glutamyltransferase  27.45 
 
 		 580 aa  190  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3753  gamma-glutamyltranspeptidase  27.06 
 
 		 580 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4761  gamma-glutamyltranspeptidase  27.79 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0368944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3924  gamma-glutamyltranspeptidase  27.62 
 
 		 577 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3742  gamma-glutamyltranspeptidase  27.23 
 
 		 580 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  30.83 
 
 		 574 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3089  Gamma-glutamyltransferase  28.78 
 
 		 530 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  30.89 
 
 		 534 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  27.76 
 
 		 587 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3726  gamma-glutamyltranspeptidase  27.62 
 
 		 581 aa  187  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.39 
 
 		 533 aa  187  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3820  gamma-glutamyltranspeptidase  27.06 
 
 		 580 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30.27 
 
 		 527 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3938  gamma-glutamyltransferase  26.7 
 
 		 588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  27.89 
 
 		 583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1221  gamma-glutamyltransferase  27.83 
 
 		 645 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134114  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2330  gamma-glutamyltransferase  28.19 
 
 		 583 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.188678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4931  gamma-glutamyltranspeptidase  28.6 
 
 		 619 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3850  gamma-glutamyltranspeptidase  27.29 
 
 		 581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  29.66 
 
 		 533 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.26 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  30.98 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>