206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2526 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  68.06 
 
 
529 aa  743  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  2.72025e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  78.98 
 
 
524 aa  863  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  70.46 
 
 
515 aa  738  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  69.32 
 
 
526 aa  756  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  100 
 
 
528 aa  1092  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  69.32 
 
 
526 aa  755  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  73.32 
 
 
495 aa  765  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  73.32 
 
 
495 aa  766  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  53.28 
 
 
490 aa  539  1e-152  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  52.41 
 
 
499 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  50.92 
 
 
494 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  49.11 
 
 
518 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  49.11 
 
 
518 aa  474  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  51.33 
 
 
496 aa  469  1e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  46.01 
 
 
492 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  46.42 
 
 
483 aa  458  1e-128  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  45.1 
 
 
483 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  45.73 
 
 
483 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  43.83 
 
 
486 aa  408  1e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  43.67 
 
 
502 aa  400  1e-110  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  43 
 
 
486 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  43.83 
 
 
502 aa  392  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  44.07 
 
 
489 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  41.91 
 
 
488 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  41.72 
 
 
499 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  44.03 
 
 
486 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  40.59 
 
 
495 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  41.65 
 
 
490 aa  379  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  40.2 
 
 
486 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  40.08 
 
 
484 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  40.08 
 
 
484 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.33 
 
 
316 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  31.39 
 
 
316 aa  153  9e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  32.46 
 
 
316 aa  153  9e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.07 
 
 
290 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.74 
 
 
255 aa  147  4e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.09 
 
 
335 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  26.61 
 
 
301 aa  79.7  1e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  27.66 
 
 
286 aa  79.7  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.25 
 
 
301 aa  78.2  4e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.47156e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  27.23 
 
 
301 aa  77.8  5e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.78733e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  26.62 
 
 
283 aa  76.3  1e-12  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  25.26 
 
 
301 aa  75.5  2e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.48 
 
 
299 aa  72  3e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.25359e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.48 
 
 
299 aa  72  3e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.23784e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.48 
 
 
299 aa  72  3e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  8.6692e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  26.25 
 
 
302 aa  71.2  4e-11  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.11 
 
 
305 aa  71.2  4e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  25.41 
 
 
301 aa  71.2  5e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  1.25802e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.11 
 
 
471 aa  70.9  6e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  25.77 
 
 
301 aa  70.5  7e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.19851e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.38 
 
 
301 aa  70.5  8e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.56532e-09  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  25.38 
 
 
301 aa  70.5  8e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26065e-07  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  25.38 
 
 
301 aa  70.5  8e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.34298e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  25.38 
 
 
301 aa  70.5  8e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.91941e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  25.69 
 
 
299 aa  69.7  1e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  26.59 
 
 
307 aa  69.7  1e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.42 
 
 
301 aa  69.3  1e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  2.59145e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  25.51 
 
 
302 aa  70.1  1e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  5.13891e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  27.66 
 
 
301 aa  68.2  4e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  27.12 
 
 
298 aa  68.2  4e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1240  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.23 
 
 
302 aa  67.4  7e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272934  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02302  ribosomal protein S6 modification protein  27.6 
 
 
305 aa  67  9e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  23.03 
 
 
459 aa  66.2  1e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.50409e-07  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  26.18 
 
 
302 aa  66.6  1e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  26.18 
 
 
302 aa  66.6  1e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  25.96 
 
 
301 aa  66.2  1e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1791  ribosomal protein S6 modification protein  23.87 
 
 
301 aa  66.2  2e-09  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  26.51 
 
 
310 aa  65.5  2e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0386  ribosomal protein S6 modification protein  23.87 
 
 
301 aa  66.2  2e-09  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.786331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  24.9 
 
 
302 aa  65.1  3e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.05 
 
 
301 aa  65.1  3e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  1.03664e-05 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29 
 
 
283 aa  65.1  3e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  1.51287e-08  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  26.88 
 
 
265 aa  65.1  3e-09  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  23.43 
 
 
301 aa  64.7  4e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2310  ribosomal protein S6 modification protein  24.7 
 
 
301 aa  64.7  4e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  24.11 
 
 
301 aa  64.3  5e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  23.41 
 
 
458 aa  64.3  5e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02460  ribosomal protein S6 modification protein  25.21 
 
 
290 aa  64.3  5e-09  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.58 
 
 
301 aa  63.9  7e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  22.92 
 
 
456 aa  63.9  7e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  9.8482e-06  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0234  ribosomal protein S6 modification protein  25.7 
 
 
301 aa  63.2  1e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3327  alpha-L-glutamate ligase  24.78 
 
 
301 aa  62.8  2e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0173  S6 modification enzyme RimK  26.14 
 
 
301 aa  62.4  2e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  26.8 
 
 
265 aa  62.8  2e-08  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  26.29 
 
 
301 aa  62.4  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.26 
 
 
301 aa  62  3e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  24.78 
 
 
301 aa  61.6  3e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  23.79 
 
 
301 aa  61.6  3e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  24.78 
 
 
301 aa  61.6  3e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.32 
 
 
302 aa  60.5  7e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3184  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.07 
 
 
292 aa  60.5  7e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  24.27 
 
 
301 aa  60.5  7e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  5.79629e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  23.77 
 
 
301 aa  60.5  8e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.58 
 
 
301 aa  60.1  9e-08  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.32 
 
 
302 aa  60.1  9e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.38 
 
 
301 aa  59.7  1e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  23.73 
 
 
301 aa  59.7  1e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0545  alpha-L-glutamate ligase  23.91 
 
 
301 aa  59.7  1e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  23.73 
 
 
301 aa  59.7  1e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>