134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2443 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  82.96 
 
 
402 aa  697  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  843  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  66.92 
 
 
429 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  56.97 
 
 
419 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  51.24 
 
 
419 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  51.72 
 
 
410 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  1.95595e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  51.49 
 
 
419 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  45.19 
 
 
414 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  45.82 
 
 
423 aa  353  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  40.83 
 
 
410 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  34.62 
 
 
476 aa  201  2e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 
1340 aa  131  2e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
956 aa  122  1e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 
456 aa  122  2e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
994 aa  119  1e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  32.22 
 
 
443 aa  119  1e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
443 aa  118  2e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  27.99 
 
 
535 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  39.46 
 
 
703 aa  110  4e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  23.71 
 
 
1119 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.79 
 
 
860 aa  106  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.55 
 
 
700 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  32.96 
 
 
1156 aa  97.8  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
499 aa  96.7  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 
902 aa  95.9  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
1106 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
442 aa  93.6  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
274 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  29.58 
 
 
537 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
432 aa  85.5  1e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
402 aa  84.7  3e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
435 aa  84  4e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
389 aa  83.2  7e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
387 aa  83.2  8e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
824 aa  82.8  1e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
405 aa  80.5  5e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
691 aa  79.3  1e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
410 aa  79.3  1e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  29.95 
 
 
537 aa  78.6  2e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
691 aa  78.6  2e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
422 aa  77.4  4e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
691 aa  77.4  4e-13  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
402 aa  75.9  1e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
411 aa  76.3  1e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
683 aa  75.9  1e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
376 aa  75.9  1e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 
396 aa  73.9  5e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
410 aa  73.2  7e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
412 aa  73.2  7e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
409 aa  72.4  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  29.82 
 
 
414 aa  72.4  1e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  31.03 
 
 
408 aa  72  2e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  27.54 
 
 
413 aa  72  2e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
468 aa  71.6  3e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
392 aa  71.2  3e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
409 aa  70.9  4e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 
402 aa  70.9  4e-11  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
892 aa  69.7  8e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
360 aa  69.7  9e-11  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
421 aa  69.7  9e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 
404 aa  69.3  1e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  30.67 
 
 
402 aa  68.6  2e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  5.3006e-10 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
403 aa  68.2  2e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  30.06 
 
 
402 aa  68.2  3e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 
406 aa  67.4  4e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
435 aa  67.8  4e-10  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 
406 aa  67.4  4e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  26.59 
 
 
397 aa  67.4  5e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
1152 aa  66.2  1e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
388 aa  65.1  2e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
429 aa  65.1  2e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  26.04 
 
 
391 aa  64.7  3e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  25.14 
 
 
399 aa  64.3  4e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  24.02 
 
 
396 aa  63.9  5e-09  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
436 aa  63.9  5e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
371 aa  63.5  6e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
397 aa  63.5  6e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 
401 aa  62.8  9e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
399 aa  62.4  1e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
399 aa  62.4  1e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
417 aa  61.6  2e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
391 aa  62.4  2e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
417 aa  61.2  3e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
406 aa  60.5  5e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.47 
 
 
413 aa  60.8  5e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
416 aa  60.5  6e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
417 aa  60.1  6e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
417 aa  60.1  6e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
405 aa  59.7  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  25.19 
 
 
420 aa  59.7  1e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  21.73 
 
 
374 aa  59.3  1e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
405 aa  59.3  1e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  36.11 
 
 
404 aa  58.2  2e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1626  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
434 aa  58.9  2e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
414 aa  57  6e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  26.97 
 
 
399 aa  56.6  8e-07  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
433 aa  56.6  8e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
408 aa  56.2  1e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.63 
 
 
429 aa  55.1  2e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
405 aa  54.3  3e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>