More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1737 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1737  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 		 354 aa  726    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391092  normal  0.794877 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0786  signal peptide peptidase  66.29 
 
 		 351 aa  508  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0792  signal peptide peptidase SppA, 36K type  66.01 
 
 		 351 aa  504  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14850  Peptidase S49, SppA  45.6 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1641  peptidase S49, SppA  45.86 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.183448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2188  putative peptidase  46.18 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1622  putative peptidase  45.42 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.270373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3838  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.93 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25600  putative peptidase  45.51 
 
 		 326 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0571616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1519  signal peptide peptidase SppA, 36K type  46.01 
 
 		 341 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0791884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1873  peptidase S49  42.13 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1908  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45.28 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000305573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3806  signal peptide peptidase SppA, 36K type  48.43 
 
 		 329 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4163  peptidase S49, SppA  45.19 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.244443  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1622  signal peptide peptidase SppA, 36K type  44.34 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1484  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.75 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1177  peptidase S49  40.36 
 
 		 350 aa  237  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.371293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2845  peptidase S49, SppA  42.19 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.25989  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0013  signal peptide peptidase SppA domain-containing protein  44.91 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  hitchhiker  0.0000208532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  41.8 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  41.8 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3656  peptidase S49  40.4 
 
 		 361 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2009  peptidase S49  43.77 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1324  peptidase S49  41.42 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010391  normal  0.909333 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2436  peptidase S49  42.9 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2189  peptidase S49  41.69 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0764473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1565  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.62 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3082  peptidase S49  39.65 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1356  peptidase S49  44.55 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1711  peptidase, U7 family protein  45.71 
 
 		 333 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.354653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1724  peptidase S49  39.61 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1560  protease  43.93 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.22727  normal  0.14187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  40.74 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2796  peptidase, U7 family protein  44.01 
 
 		 333 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0383302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2486  peptidase, U7 family protein  45.91 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00952675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2798  peptidase, U7 family protein  45 
 
 		 333 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2859  peptidase, U7 family protein  45.91 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0524  peptidase, U7 family protein  45.91 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2915  peptidase  45.91 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641289  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1809  peptidase, U7 family protein  45.91 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2271  peptidase S49  40.69 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0995  peptidase S49  40.82 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1428  peptidase S49  40.97 
 
 		 311 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0991  peptidase S49  40.52 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4227  peptidase S49  40.75 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1073  peptidase S49  41.07 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.476485  normal  0.159448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0635  peptidase S49  41.07 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1115  peptidase S49  41.07 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1478  signal peptide peptidase SppA, putative  42.21 
 
 		 327 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.484654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1066  peptidase S49  39.94 
 
 		 316 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.609608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0925  peptidase S49  41.72 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.474149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5278  peptidase S49  44.26 
 
 		 348 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1382  peptidase S49  41.23 
 
 		 347 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1066  family S49 unassigned peptidase  42.15 
 
 		 334 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1595  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.69 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39752  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1759  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.59 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0822  peptidase S49  41.41 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.957844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0399  peptidase S49  40.71 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.673483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1193  peptidase S49  40.7 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2639  peptidase S49  44.63 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0588  peptidase S49  39.68 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0721247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1713  hypothetical protein  40.43 
 
 		 318 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1713  hypothetical protein  40.43 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0660  putative protease transmembrane protein  43.5 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3286  peptidase S49  43.49 
 
 		 347 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0392  peptidase S49  41.96 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4784  peptidase S49  39.69 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2918  peptidase S49  41.54 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2241  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.38 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1240  peptidase S49  40.73 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2084  signal peptide peptidase  38.1 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0098  signal peptide peptidase SppA, 36K type  38.1 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1144  peptidase S49  36.29 
 
 		 312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.148766  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  38.19 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  40.97 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.97 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1091  peptidase S49  39.55 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  41.4 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  37.66 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0708  peptidase S49  40.44 
 
 		 286 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884772  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3213  peptidase S49  37.74 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00577792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1235  peptidase S49  41.51 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0947  proteinase sohB  42.11 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2523  peptidase S49  37.9 
 
 		 265 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0725  peptidase S49  36.63 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0514  peptidase S49  39.37 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0130  peptidase S49  40.89 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0396  protease IV, putative  40.09 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.690183  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0405  putative protease IV  40.09 
 
 		 368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0640  peptidase S49  37.93 
 
 		 265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  39.46 
 
 		 283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  37.98 
 
 		 297 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  35.83 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.73 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.74 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0385  S49 family peptidase  39.53 
 
 		 283 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0461  peptidase S49  39.52 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.98 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4351  peptidase S49  40.61 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  hitchhiker  0.00437217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  38.32 
 
 		 267 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>