25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0948 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0948  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  569  1e-161  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000870285  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1336  hypothetical protein  34.37 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000287065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1033  RDD domain-containing protein  34.88 
 
 		 332 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0732  RDD domain-containing protein  26.39 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.70222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  29.45 
 
 		 214 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  20.54 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  26.34 
 
 		 167 aa  49.7  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  25.48 
 
 		 171 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  25.14 
 
 		 393 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  30.14 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  28.72 
 
 		 159 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  30.26 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2194  FHA domain containing protein  25.81 
 
 		 397 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0180026  hitchhiker  0.00877929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3395  RDD domain-containing protein  22.38 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  24.54 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  24 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.09 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  35.06 
 
 		 174 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06647  hypothetical protein  32.1 
 
 		 147 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  26.35 
 
 		 175 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2360  hypothetical protein  24.52 
 
 		 409 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  26.17 
 
 		 185 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3132  hypothetical protein  26.84 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2364  RDD domain containing protein  21.38 
 
 		 160 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>