More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3011 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  100 
 
 		 145 aa  289  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  70.34 
 
 		 149 aa  222  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  70.21 
 
 		 152 aa  219  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  69.66 
 
 		 149 aa  214  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  67.59 
 
 		 149 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  66.2 
 
 		 150 aa  207  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  68.53 
 
 		 147 aa  203  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  66.2 
 
 		 150 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  59.15 
 
 		 148 aa  186  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  59.71 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  62.68 
 
 		 152 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  60.54 
 
 		 151 aa  173  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  57.93 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  61.48 
 
 		 167 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  54.48 
 
 		 153 aa  166  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  54.48 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  55.32 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0149  response regulator receiver protein  63.38 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.549388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0133  response regulator receiver protein  63.38 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  54.61 
 
 		 162 aa  161  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  57.45 
 
 		 164 aa  158  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  57.45 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  53.9 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  53.9 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  51.72 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  53.9 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  50.71 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  53.1 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  53.9 
 
 		 153 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  53.96 
 
 		 153 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  48.61 
 
 		 146 aa  147  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  46.53 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  50 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  50 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0166  response regulator receiver protein  48.15 
 
 		 137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  47.48 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  48.95 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  48.2 
 
 		 146 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  47.83 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  53.19 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  48.92 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  44.37 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  47.1 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  45.86 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  48.61 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  43.84 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2877  response regulator receiver domain-containing protein  46.38 
 
 		 154 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  46.97 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2987  response regulator receiver protein  45.19 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309877  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5014  response regulator receiver protein  47.29 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  48.48 
 
 		 150 aa  123  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  42.45 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  45.32 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  45.32 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  44.6 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  46.04 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  41.3 
 
 		 150 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0991  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0104  response regulator, putative  48.12 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  44.85 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  44.2 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  45.93 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0665  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  43.61 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.03 
 
 		 146 aa  116  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  43.18 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  43.17 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  43.94 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  43.54 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  41.01 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1549  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  41.98 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0807  response regulator receiver protein  39.16 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2318  response regulator receiver domain-containing protein  38.82 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.824506  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1869  response regulator receiver protein  39.22 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0826039  normal  0.0620509 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  42.45 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  42.45 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  42.45 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  42.45 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  42.45 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  42.45 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  42.45 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>