More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2690 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  80.12 
 
 		 690 aa  1183    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0346  elongation factor G  78.58 
 
 		 691 aa  1166    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  76.67 
 
 		 690 aa  1127    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2690  elongation factor G  100 
 
 		 691 aa  1420    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  81.01 
 
 		 691 aa  1210    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0222  elongation factor G  80.7 
 
 		 691 aa  1203    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0308  elongation factor G  76.38 
 
 		 693 aa  1120    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0116517  hitchhiker  0.00119531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  42.84 
 
 		 695 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  42.23 
 
 		 707 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  41.31 
 
 		 679 aa  581  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  40.26 
 
 		 695 aa  580  1e-164  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  43.13 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.91 
 
 		 692 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  39.97 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  39.3 
 
 		 701 aa  547  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  39.59 
 
 		 697 aa  547  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  39.8 
 
 		 694 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  39.57 
 
 		 697 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7102  elongation factor G  40.2 
 
 		 710 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  39.45 
 
 		 699 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  38.45 
 
 		 694 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  39.97 
 
 		 697 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  39.15 
 
 		 701 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  37.08 
 
 		 691 aa  535  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  39.85 
 
 		 673 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  39.31 
 
 		 696 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  39.31 
 
 		 696 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  38.95 
 
 		 680 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  38.52 
 
 		 692 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  38.12 
 
 		 696 aa  524  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  38.78 
 
 		 682 aa  522  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  38.26 
 
 		 688 aa  522  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  37.04 
 
 		 692 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  37.41 
 
 		 689 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  37.46 
 
 		 697 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  36.23 
 
 		 696 aa  512  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  37.79 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  36.54 
 
 		 692 aa  505  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  38.92 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  36.55 
 
 		 697 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  37.96 
 
 		 670 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  37.09 
 
 		 697 aa  501  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0933  elongation factor G  35.56 
 
 		 719 aa  497  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.246025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  36.84 
 
 		 692 aa  497  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  36.71 
 
 		 701 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  36.28 
 
 		 692 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  35.16 
 
 		 698 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  37.57 
 
 		 667 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  36.02 
 
 		 692 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  35.94 
 
 		 698 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  36.02 
 
 		 692 aa  492  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  36.02 
 
 		 692 aa  492  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  35.87 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  36.27 
 
 		 692 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  37.16 
 
 		 703 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  36.02 
 
 		 692 aa  492  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  36.02 
 
 		 692 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  38.16 
 
 		 691 aa  492  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4753  translation elongation factor G  35.61 
 
 		 701 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  35.58 
 
 		 693 aa  491  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  36.34 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  36.73 
 
 		 701 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  37.64 
 
 		 700 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  35.85 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  35.8 
 
 		 692 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4059  elongation factor G  35.51 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00239546  hitchhiker  0.000000505947 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  35.09 
 
 		 692 aa  486  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  35.51 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  35.87 
 
 		 692 aa  489  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  35.58 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  36.51 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  35.87 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4467  elongation factor G  35.51 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  35.51 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  0.0000182182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  35.27 
 
 		 698 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  35.27 
 
 		 698 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  35.4 
 
 		 699 aa  486  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  35.51 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  35.72 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  36.31 
 
 		 692 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  35.54 
 
 		 699 aa  487  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0210  elongation factor G  35.36 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000406039  unclonable  0.0000140529 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  36.28 
 
 		 683 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  35.53 
 
 		 698 aa  488  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  35.1 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  35.72 
 
 		 691 aa  485  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  36.18 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  35.85 
 
 		 683 aa  485  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  36.51 
 
 		 699 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  35.23 
 
 		 691 aa  485  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  35.37 
 
 		 692 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  35.65 
 
 		 698 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000344622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  35.26 
 
 		 692 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  34.6 
 
 		 695 aa  484  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  35.38 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  35.46 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  35.69 
 
 		 694 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  35.32 
 
 		 691 aa  482  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  35.81 
 
 		 695 aa  480  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  35.85 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>