More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1781 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 159 aa  317  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  89.94 
 
 		 160 aa  289  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  89.31 
 
 		 159 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  86.16 
 
 		 159 aa  280  6.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  86.16 
 
 		 176 aa  278  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  80 
 
 		 160 aa  256  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  78.75 
 
 		 160 aa  252  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  52.32 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  45.22 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  47.02 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  46.45 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  45 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 203 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  47.68 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 160 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  43.14 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>