242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0403 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  590  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  77.29 
 
 		 295 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  75.25 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  73.56 
 
 		 295 aa  434  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  70.51 
 
 		 300 aa  421  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  63.23 
 
 		 291 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  61.69 
 
 		 295 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  41.02 
 
 		 292 aa  195  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  35.47 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  37.97 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  35.91 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  38.94 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  35.12 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  34.35 
 
 		 293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  34.12 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  35.12 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  35.45 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  35.45 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  35.45 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  35.45 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  35.45 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  35.12 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  38.13 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  35.45 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  37.37 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  35.37 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  34.92 
 
 		 292 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  35.4 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  34.45 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  35.02 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  36.58 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  34.78 
 
 		 289 aa  158  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  34.12 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  36.58 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  34.92 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  36.7 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  34.11 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  33.44 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  31.53 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  34.9 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0138  hypothetical protein  32.2 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  34.56 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  35.31 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  33 
 
 		 292 aa  149  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  33.78 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1631  hypothetical protein  34.13 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  34.9 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1143  hypothetical protein  33.66 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.37182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  35.59 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  32.89 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  30.1 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101858  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  34.54 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  31.19 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1679  hypothetical protein  32.88 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.699908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  33.56 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  31.63 
 
 		 286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  31.88 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  35 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  31.77 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  31.29 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  33.44 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02195  hypothetical protein  32.53 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  30.51 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  30.17 
 
 		 291 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  32.33 
 
 		 288 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  33.89 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  30.51 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2167  hypothetical protein  32.99 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  34.8 
 
 		 288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  33.22 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0098  hypothetical protein  31.88 
 
 		 294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  32.78 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  30.92 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1469  domain of unknown function DUF1732  32.43 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000162947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  30.74 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0250  hypothetical protein  31.58 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  30.51 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  33 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0513  hypothetical protein  28.52 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0201327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  31.86 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0101  hypothetical protein  29.93 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0157028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  32.73 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  32.21 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  31.54 
 
 		 287 aa  123  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  31.65 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  30.85 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  30.85 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  31.86 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  31.99 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  31.99 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  30.85 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  30.85 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  30.51 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  28.81 
 
 		 287 aa  122  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  30.85 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  30.51 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  31.56 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>