More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0110 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  82.12 
 
 		 151 aa  257  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  82.55 
 
 		 151 aa  254  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  80.79 
 
 		 151 aa  248  1e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  78.81 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  69.59 
 
 		 148 aa  216  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  66.67 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  46.94 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  43.06 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.67 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 171 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  42.96 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.27 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  41.89 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  38.16 
 
 		 194 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27890  ribosomal protein L9  40 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00233062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  42.96 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  40.54 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  39.58 
 
 		 209 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  37.67 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  37.84 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.46 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  36.55 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  38.41 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  40.28 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  38.51 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  38.62 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 148 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  41.35 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 189 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  38.56 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  37.09 
 
 		 209 aa  103  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  36.91 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0025  ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00173008  normal  0.984167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  40.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  36.42 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  38.78 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  37.93 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5262  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00409171  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  38.3 
 
 		 189 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1084  50S ribosomal protein L9  36.84 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00450273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  38.67 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  36.73 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  40.26 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>