More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0335 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
476 aa  986    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0151  methyltransferase type 12  46.77 
 
 
491 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319391  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1201  glycosyltransferase  48.67 
 
 
476 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0256337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0492  hypothetical protein  45.63 
 
 
502 aa  418  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3985  glycosyl transferase family protein  46.07 
 
 
472 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16881  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 
363 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16771  glycosyl transferase family protein  36.31 
 
 
363 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1589  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  28.63 
 
 
276 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
272 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  29.32 
 
 
285 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
283 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.88 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
257 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12873  glycosyltransferase  30.71 
 
 
238 aa  94.4  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.514986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
271 aa  94  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
266 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
287 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
514 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
301 aa  89.7  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 
249 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
284 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  30.47 
 
 
410 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
227 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
227 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
420 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
227 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
230 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
227 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
282 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
336 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.13 
 
 
382 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
255 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
231 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  28.11 
 
 
240 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
685 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
231 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0964  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.824604  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
261 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
238 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  29.81 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1270  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
250 aa  67  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
273 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
314 aa  67  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
347 aa  67  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2157  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.32 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0011  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0009  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
319 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.96 
 
 
864 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
394 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
308 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  25.22 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
378 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
234 aa  65.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
273 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  27.57 
 
 
253 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
267 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
312 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
331 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
519 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
350 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>