70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0091 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0094  glutamate synthase (ferredoxin)  84.24 
 
 		 4746 bp  1332    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000146352  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0091    100 
 
 		 1843 bp  3653    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.306998  normal  0.394026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3243  Glutamate synthase (ferredoxin)  78.9 
 
 		 4800 bp  95.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3776  glutamate synthase (NADH) large subunit  90.41 
 
 		 4539 bp  89.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2965  glutamate synthase (large subunit) oxidoreductase protein  78.57 
 
 		 4749 bp  87.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3591  Glutamate synthase (ferredoxin)  79.66 
 
 		 4704 bp  87.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213312  hitchhiker  0.00000278043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2933  glutamate synthase (ferredoxin)  86.9 
 
 		 4734 bp  79.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761272  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  97.73 
 
 		 7072 bp  79.8  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0365  glutamate synthase (NADH) large subunit  82.44 
 
 		 4704 bp  77.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.512142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0217  glutamate synthase (NADH) large subunit  85.39 
 
 		 4635 bp  73.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3126  glutamate synthase (NADH) large subunit  81.75 
 
 		 4803 bp  73.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  95.35 
 
 		 4530 bp  69.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0741  glutamate synthase (NADH) large subunit  81.34 
 
 		 4734 bp  67.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.704994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1007  glutamate synthase (ferredoxin)  93.48 
 
 		 4602 bp  67.9  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.465703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2788  glutamate synthase (ferredoxin)  82.73 
 
 		 4704 bp  67.9  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  93.33 
 
 		 4563 bp  65.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  88.52 
 
 		 4656 bp  65.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2705  glutamate synthase (ferredoxin)  81.2 
 
 		 4980 bp  65.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0381  glutamate synthase (ferredoxin)  81.2 
 
 		 4704 bp  65.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0402  glutamate synthase (ferredoxin)  81.2 
 
 		 4704 bp  65.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3499  glutamate synthase (NADH) large subunit  81.2 
 
 		 4704 bp  65.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3263  glutamate synthase (NADH) large subunit  77.6 
 
 		 4896 bp  63.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0761  putative glutamate synthase, ferredoxin-dependent  93.18 
 
 		 4608 bp  63.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  80.71 
 
 		 4740 bp  63.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.456903 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_51214  ferredoxin-dependent glutamate synthase, fusion of large and small subunits  85 
 
 		 5070 bp  63.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  97.14 
 
 		 4464 bp  61.9  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0506  glutamate synthase (ferredoxin)  92.86 
 
 		 4500 bp  60  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2896  Glutamate synthase (ferredoxin)  78.15 
 
 		 4713 bp  60  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.113267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2131  Glutamate synthase (ferredoxin)  88.89 
 
 		 4509 bp  60  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.150906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0683  glutamate synthase (ferredoxin)  79.75 
 
 		 4743 bp  60  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.146525  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  92.86 
 
 		 7014 bp  60  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0493  glutamate synthase (ferredoxin)  92.86 
 
 		 4500 bp  60  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3031  glutamate synthase (ferredoxin)  90 
 
 		 4662 bp  60  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2395  glutamate synthase (ferredoxin)  89.8 
 
 		 4761 bp  58  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0321  glutamate synthase (ferredoxin)  80.45 
 
 		 4704 bp  58  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.917459  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  92.68 
 
 		 4551 bp  58  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0330  glutamate synthase (ferredoxin)  80.45 
 
 		 4704 bp  58  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466005 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1604  glutamate synthase (ferredoxin)  90.91 
 
 		 4665 bp  56  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.505347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  86.67 
 
 		 4449 bp  56  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  86.67 
 
 		 7425 bp  56  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0842  Glutamate synthase (ferredoxin)  86.44 
 
 		 4683 bp  54  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  92.31 
 
 		 4464 bp  54  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  85.71 
 
 		 4560 bp  54  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  89.36 
 
 		 4590 bp  54  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  92.31 
 
 		 4551 bp  54  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  88 
 
 		 4386 bp  52  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000785816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0612  Glutamate synthase (ferredoxin)  89.13 
 
 		 4620 bp  52  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  90.24 
 
 		 4752 bp  50.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  90.24 
 
 		 4575 bp  50.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  87.76 
 
 		 4584 bp  50.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3014  glutamate synthase, large subunit  86.79 
 
 		 4875 bp  50.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  93.94 
 
 		 4548 bp  50.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0791  glutamate synthase (NADH) large subunit  84.62 
 
 		 4743 bp  50.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.116614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1767  glutamate synthase, large subunit  85 
 
 		 4704 bp  48.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  90 
 
 		 4425 bp  48.1  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2736  glutamate synthase, large subunit  85 
 
 		 4746 bp  48.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3718  glutamate synthase, large subunit  85 
 
 		 4947 bp  48.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0502  glutamate synthase (ferredoxin)  90 
 
 		 4602 bp  48.1  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.154267  normal  0.477392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  88.64 
 
 		 4647 bp  48.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2626  glutamate synthase (ferredoxin)  88.64 
 
 		 4758 bp  48.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.77642  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3216  glutamate synthase, large subunit  85 
 
 		 4704 bp  48.1  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  93.75 
 
 		 5734 bp  48.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0781  Glutamate synthase (ferredoxin)  90 
 
 		 4602 bp  48.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3690  glutamate synthase, large subunit  85 
 
 		 4704 bp  48.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3747  glutamate synthase, large subunit  85 
 
 		 4704 bp  48.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2787  glutamate synthase, large subunit  85 
 
 		 4704 bp  48.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13895  ferredoxin-dependent glutamate synthase [NADPH] large subunit gltB  88.64 
 
 		 4584 bp  48.1  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  85.71 
 
 		 4743 bp  48.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5558  glutamate synthase (ferredoxin)  86.54 
 
 		 4731 bp  48.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  0.943679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  85 
 
 		 4458 bp  48.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>