More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4020 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1820  dihydropyrimidine dehydrogenase  73.26 
 
 		 434 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_004310  BR0282  dihydropyrimidine dehydrogenase  70.7 
 
 		 436 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0365  dihydropyrimidine dehydrogenase  70.67 
 
 		 436 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4151  dihydropyrimidine dehydrogenase  72.98 
 
 		 436 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2862  dihydropyrimidine dehydrogenase  73.85 
 
 		 439 aa  681    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0187  dihydropyrimidine dehydrogenase  73.02 
 
 		 434 aa  651    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3281  dihydropyrimidine dehydrogenase  72.39 
 
 		 437 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.919759  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3449  dihydropyrimidine dehydrogenase  72.06 
 
 		 437 aa  664    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591903  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1458  dihydropyrimidine dehydrogenase  72.33 
 
 		 434 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.850585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1363  dihydropyrimidine dehydrogenase  71.86 
 
 		 432 aa  637    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.709069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1500  dihydropyrimidine dehydrogenase  70.23 
 
 		 434 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4020  dihydropyrimidine dehydrogenase  100 
 
 		 435 aa  900    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2055  dihydropyrimidine dehydrogenase  72.62 
 
 		 437 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3029  dihydropyrimidine dehydrogenase  73.09 
 
 		 437 aa  669    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00152592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0045  dihydropyrimidine dehydrogenase  73.78 
 
 		 437 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2361  dihydropyrimidine dehydrogenase  72.62 
 
 		 437 aa  661    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  74.13 
 
 		 442 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2712  dihydropyrimidine dehydrogenase  70.44 
 
 		 434 aa  631  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462922  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0296  dihydropyrimidine dehydrogenase  70.47 
 
 		 436 aa  633  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6035  dihydropyrimidine dehydrogenase  69.37 
 
 		 441 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6712  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.67 
 
 		 437 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.302469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1595  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.44 
 
 		 437 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5721  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.13 
 
 		 435 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85505  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5965  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.13 
 
 		 435 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.663226  normal  0.568701 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6236  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.44 
 
 		 437 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.182337  normal  0.153451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1534  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.21 
 
 		 436 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.553983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.51 
 
 		 444 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6656  dihydropyrimidine dehydrogenase  67.37 
 
 		 438 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.569417  normal  0.0129308 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5351  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.44 
 
 		 435 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.162671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2689  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.05 
 
 		 444 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3443  dihydropyrimidine dehydrogenase  66.36 
 
 		 424 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4038  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.29 
 
 		 424 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0540  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.52 
 
 		 424 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1800  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.29 
 
 		 424 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.287074  normal  0.942647 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05740  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.29 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1834  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.52 
 
 		 424 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3640  dihydropyrimidine dehydrogenase  64.29 
 
 		 424 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0957824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2199  dihydropyrimidine dehydrogenase  62.99 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2213  dihydropyrimidine dehydrogenase  57.53 
 
 		 429 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3448  dihydropyrimidine dehydrogenase  54.77 
 
 		 422 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117206  normal  0.0570725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2108  dihydroorotate dehydrogenase family protein  49.44 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.110161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1889  dihydroorotate dehydrogenase family protein  49.11 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0110983  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  41.08 
 
 		 411 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.83 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.83 
 
 		 411 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.83 
 
 		 411 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.83 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.59 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.34 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  40.34 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.34 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.34 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  40.34 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.34 
 
 		 411 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.34 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  40.34 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  39.85 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2025  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.83 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2085  dihydroorotate dehydrogenase family protein  27.76 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00414883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1743  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.25 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0450  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.23 
 
 		 304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.187702  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0832  dihydroorotate dehydrogenase family protein  30.16 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2286  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.75 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000160117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1380  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.69 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0444  dihydroorotate dehydrogenase  30.05 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0618  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.14 
 
 		 307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.056994  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1225  dihydroorotate dehydrogenase 1B  31.13 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0613844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2127  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  40.62 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.95796 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0472  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.23 
 
 		 304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.730654  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1436  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.55 
 
 		 304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.405217  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1466  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.82 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1092  dihydroorotate dehydrogenase 1B  33.04 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.149271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2629  dihydroorotate dehydrogenase 1B  38.62 
 
 		 304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.372998  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1814  dihydroorotate dehydrogenase 1B  37.44 
 
 		 302 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00465279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4014  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.18 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1198  dihydroorotate dehydrogenase 1B  29.58 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.770719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1424  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.94 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.601121  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2200  dihydroorotate dehydrogenase family protein  32.88 
 
 		 308 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0912  dihydroorotate dehydrogenase 1B  28.43 
 
 		 305 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53908  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3279  dihydroorotate dehydrogenase 1  34.48 
 
 		 321 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09420  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  40.21 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2762  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  32.23 
 
 		 303 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0019  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.78 
 
 		 304 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1663  dihydroorotate dehydrogenase family protein  35.47 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000377649  hitchhiker  0.00130858 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1919  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.73 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1950  dihydroorotate dehydrogenase family protein  31.56 
 
 		 297 aa  106  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000449747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1469  dihydroorotate dehydrogenase 1B  30.97 
 
 		 311 aa  106  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0123797  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1049  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.79 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2533  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.27 
 
 		 309 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1296  putative oxidoreductase  29.84 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000054569  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1390  dihydroorotate dehydrogenase family protein  28.53 
 
 		 303 aa  104  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0785  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.17 
 
 		 299 aa  104  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0056  dihydroorotate oxidase B, catalytic subunit  37.89 
 
 		 308 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2143  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.24 
 
 		 308 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3711  dihydroorotate dehydrogenase 1B  35.23 
 
 		 309 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.657474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0072  dihydroorotate dehydrogenase family protein  36.36 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1686  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.89 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00226183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2846  dihydroorotate dehydrogenase family protein  37.5 
 
 		 302 aa  103  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2399  dihydroorotate dehydrogenase 1B  36.22 
 
 		 305 aa  103  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3929  dihydroorotate dehydrogenase 1B  34.72 
 
 		 309 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>