More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0972 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  100 
 
 
456 aa  931    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  57.3 
 
 
446 aa  512  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  56.6 
 
 
451 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  56.6 
 
 
451 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  55.93 
 
 
445 aa  503  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  51.01 
 
 
442 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  50.23 
 
 
446 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  49.89 
 
 
445 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  48.9 
 
 
444 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  48.64 
 
 
447 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  48.99 
 
 
453 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  47.36 
 
 
448 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  46.92 
 
 
453 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  45.93 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  47.44 
 
 
456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  48.33 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  45.78 
 
 
459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  47.2 
 
 
456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  45.71 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  45.9 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  46.94 
 
 
439 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  47.66 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  45.37 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  46.71 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  48.51 
 
 
441 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  48.08 
 
 
440 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  45.37 
 
 
456 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
449 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  47.98 
 
 
442 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  46.07 
 
 
449 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  47.74 
 
 
456 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
449 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  46.33 
 
 
445 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
457 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
457 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  45.84 
 
 
471 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  44.22 
 
 
442 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  46.28 
 
 
444 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  46.61 
 
 
460 aa  378  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  47.06 
 
 
458 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  42.79 
 
 
454 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
446 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  47.61 
 
 
451 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  45.56 
 
 
458 aa  374  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  43.82 
 
 
466 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  42.51 
 
 
468 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  43.82 
 
 
466 aa  372  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  45.41 
 
 
468 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.48 
 
 
462 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  45.86 
 
 
468 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  45.19 
 
 
468 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  45.19 
 
 
468 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
468 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
481 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  45.19 
 
 
468 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  43.26 
 
 
466 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
468 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  45.19 
 
 
468 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.67 
 
 
457 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  46.7 
 
 
450 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  45.11 
 
 
468 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  41.67 
 
 
453 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  42.57 
 
 
452 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  41.26 
 
 
461 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  40.32 
 
 
461 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  44.02 
 
 
463 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  44.83 
 
 
446 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  44.74 
 
 
468 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  44.74 
 
 
468 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.81 
 
 
461 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  41.35 
 
 
460 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
461 aa  365  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  40.27 
 
 
460 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  44.06 
 
 
476 aa  363  3e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  40.32 
 
 
451 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  44.74 
 
 
468 aa  363  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  44.74 
 
 
468 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  44.74 
 
 
467 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  44.29 
 
 
476 aa  362  6e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  43.62 
 
 
473 aa  362  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  44.3 
 
 
472 aa  362  9e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  45.19 
 
 
468 aa  362  9e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  41.99 
 
 
452 aa  362  9e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
465 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  44.74 
 
 
468 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  44.07 
 
 
468 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  44.07 
 
 
451 aa  362  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  44.07 
 
 
468 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  43.17 
 
 
443 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  45.19 
 
 
471 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  40.22 
 
 
455 aa  360  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>