More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3095 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 469 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 491 aa  1004    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  76.12 
 
 		 472 aa  739    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  69.1 
 
 		 469 aa  678    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  68.03 
 
 		 469 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  71.89 
 
 		 487 aa  715    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  68.88 
 
 		 469 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  77.4 
 
 		 471 aa  765    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  76.51 
 
 		 500 aa  772    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  58.86 
 
 		 481 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.42 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 471 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 477 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  56.29 
 
 		 477 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  57.02 
 
 		 477 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 477 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 477 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  57.02 
 
 		 477 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  56.41 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 470 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  56.42 
 
 		 483 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.36 
 
 		 484 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  58.42 
 
 		 476 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  54.29 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.86 
 
 		 483 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  53.96 
 
 		 483 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 493 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 491 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 493 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 493 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 493 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  54.6 
 
 		 470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  53.83 
 
 		 491 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  56.38 
 
 		 481 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  53.38 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 473 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  52.11 
 
 		 478 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 478 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  51.17 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  54.26 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 473 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.73 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  48.5 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  48.09 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5025  transcriptional regulator  52.04 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4500  GntR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 472 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6902  transcriptional regulator  49.36 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78999  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  48.18 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  46.81 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.6 
 
 		 483 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  46.82 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 478 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  48.41 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.06 
 
 		 472 aa  445  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.93 
 
 		 483 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  47.35 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  47.35 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  47.35 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  47.35 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.49 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 470 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  47.35 
 
 		 474 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.86 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  47.22 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  47.13 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 478 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  46.2 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  47.91 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  47.91 
 
 		 433 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 469 aa  428  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  45.78 
 
 		 474 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  45.57 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>