94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2531 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
232 aa  474  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  75 
 
 
236 aa  370  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  72.46 
 
 
236 aa  356  2e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  69.92 
 
 
236 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  66.95 
 
 
236 aa  336  2e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  67.8 
 
 
236 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  66.1 
 
 
288 aa  331  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  66.53 
 
 
236 aa  325  4e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  65.68 
 
 
236 aa  320  1e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  64.83 
 
 
236 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  58.72 
 
 
238 aa  272  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 
230 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 
236 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
234 aa  147  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 
235 aa  131  8e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
223 aa  127  1e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  35.17 
 
 
229 aa  127  2e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  34.35 
 
 
224 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 
236 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
224 aa  121  1e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
222 aa  120  1e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 
229 aa  121  1e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 
229 aa  120  2e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 
229 aa  120  2e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
223 aa  120  2e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 
229 aa  120  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 
229 aa  120  2e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
223 aa  120  2e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 
229 aa  120  2e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 
229 aa  120  2e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  33.05 
 
 
229 aa  120  2e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  33.19 
 
 
220 aa  120  2e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 
222 aa  117  1e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
224 aa  117  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 
236 aa  115  4e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
224 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
224 aa  115  8e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
224 aa  115  8e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 
244 aa  114  9e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
224 aa  114  1e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 
244 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
224 aa  111  8e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 
227 aa  111  8e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
225 aa  110  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
234 aa  110  2e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 
271 aa  108  7e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
224 aa  108  8e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 
224 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
224 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
224 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  31.54 
 
 
224 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
250 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 
225 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.9 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  29.36 
 
 
231 aa  84  2e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  30.8 
 
 
218 aa  76.6  3e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 
209 aa  61.2  1e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  27.9 
 
 
237 aa  60.8  2e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  29.64 
 
 
223 aa  52.8  4e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
203 aa  50.8  2e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
203 aa  50.8  2e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
203 aa  50.8  2e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
220 aa  49.7  4e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.45 
 
 
447 aa  48.9  6e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  34.44 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  37.5 
 
 
208 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 
223 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  26.12 
 
 
225 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  33.78 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  34.83 
 
 
211 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  24.89 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
240 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  23.98 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  27.2 
 
 
202 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  36.76 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.22 
 
 
164 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.34 
 
 
203 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.61375e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  46.97 
 
 
214 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  33.7 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  24.26 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  23.81 
 
 
201 aa  42  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 
228 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  31.76 
 
 
236 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  33.71 
 
 
211 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  27.27 
 
 
157 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>