150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2717 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  100 
 
 		 303 aa  626  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  30.13 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  32.99 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  33.45 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  32.66 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  32.66 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  28.52 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  30.88 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  30.2 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  29.51 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  32.52 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  29.39 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  27.34 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  31.89 
 
 		 325 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  31.23 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  29.12 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  29.24 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  31.94 
 
 		 327 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  28.38 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  30.03 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  27.8 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  30.69 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  29.21 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  27.93 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  28.77 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  27.48 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  28.28 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  27.4 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  28.09 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  26.74 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  27.46 
 
 		 310 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  29.51 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  29.41 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  29.08 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  27.27 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  29 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  27.4 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  28.62 
 
 		 297 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  30.53 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  30.22 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  27.88 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  28.1 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  30.3 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  29.67 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  25.6 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  27.18 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  27.14 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  29.65 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  28.67 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  27.74 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  25.95 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  27.74 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  32.69 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  26.91 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  30.67 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  26.6 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  26.6 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  26.04 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  26.15 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  25.68 
 
 		 304 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  25.73 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  25.73 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  25.68 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  25.68 
 
 		 321 aa  112  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  25.68 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  25.68 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  25.68 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  26.19 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  28.08 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  31.88 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  25.17 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  25.34 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  25.52 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  25.84 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  24.57 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  28.14 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  28.44 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  26.1 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  26.1 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  27.8 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  26.1 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  24.66 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  27.12 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  26.38 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  26.35 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  26.1 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  26.05 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  28.38 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  25.51 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  25.42 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  28.02 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>