More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2524 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  59.73 
 
 		 548 aa  638    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  59.73 
 
 		 548 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 544 aa  644    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  64.19 
 
 		 544 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1361  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 546 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396838  normal  0.215405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0945  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 545 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0596122  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 545 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  62.22 
 
 		 542 aa  670    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  62.02 
 
 		 547 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0699  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 546 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.0116796 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1356  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 545 aa  634    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.649732  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0195  chaperonin GroEL  62.4 
 
 		 546 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0704  chaperonin GroEL  60.46 
 
 		 545 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3708  chaperonin GroEL  60.5 
 
 		 545 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.889887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 550 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0743  chaperonin GroEL  61.93 
 
 		 548 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0724  chaperonin GroEL  61.93 
 
 		 548 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3153  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 546 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1234  chaperonin GroEL  59.59 
 
 		 545 aa  635    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0426  chaperonin GroEL  62.12 
 
 		 550 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000639435  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 547 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0091  chaperonin GroEL (Hsp60, Cpn10)  61.44 
 
 		 547 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000116999  normal  0.52877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  64.9 
 
 		 542 aa  677    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2192  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 545 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2574  chaperonin GroEL  60.38 
 
 		 548 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 546 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4585  chaperonin GroEL  61.33 
 
 		 545 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.3483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  62.43 
 
 		 554 aa  679    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4501  chaperonin GroEL  59.32 
 
 		 548 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356522  hitchhiker  0.00205266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  60.57 
 
 		 547 aa  646    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3117  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 546 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.222092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 546 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0428  chaperonin GroEL  61.64 
 
 		 548 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0542  chaperonin GroEL  62.07 
 
 		 547 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000020634  normal  0.698451 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1306  chaperonin GroEL  62.26 
 
 		 547 aa  645    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000255221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  62.74 
 
 		 546 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2473  chaperonin GroEL  63.69 
 
 		 548 aa  684    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1196  chaperonin GroEL  64.26 
 
 		 547 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.106073  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1936  chaperonin GroEL  62.07 
 
 		 547 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000102441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  61.36 
 
 		 552 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  60.96 
 
 		 543 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  60.57 
 
 		 547 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 539 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  60.27 
 
 		 536 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2742  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 550 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 546 aa  661    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2394  chaperonin GroEL  65.27 
 
 		 548 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0117412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  66.73 
 
 		 547 aa  717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1836  chaperonin GroEL  59.85 
 
 		 550 aa  638    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253263  normal  0.0261483 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2493  chaperonin Cpn60, GroEL, large subunit of GroESL  58.49 
 
 		 544 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0259197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0035  chaperonin GroEL  61.64 
 
 		 547 aa  647    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0226788  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3358  chaperonin GroEL  60.04 
 
 		 546 aa  641    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  59.74 
 
 		 552 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  59.89 
 
 		 547 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  62.29 
 
 		 554 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4726  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 551 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  61.79 
 
 		 544 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 550 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  60.27 
 
 		 540 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  61.07 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  60.27 
 
 		 540 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0912  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 550 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31421  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1172  chaperonin GroEL  60.27 
 
 		 544 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.368643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0422  chaperonin GroEL  60.88 
 
 		 545 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2227  chaperonin GroEL  62.67 
 
 		 547 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4127  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 550 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.176849  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2160  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 547 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.343509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1176  chaperonin GroEL  61.71 
 
 		 545 aa  635    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.412382  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2594  chaperonin GroEL  62.1 
 
 		 546 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3654  chaperonin GroEL  61.33 
 
 		 545 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2567  chaperonin GroEL  60.57 
 
 		 552 aa  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164094  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0616  chaperonin GroEL  62.17 
 
 		 547 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0352411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0657  chaperonin GroEL  60.42 
 
 		 549 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000001138  decreased coverage  0.00270634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  62.8 
 
 		 553 aa  669    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2341  chaperonin GroEL  60.11 
 
 		 550 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.551329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0597  chaperonin GroEL  60.19 
 
 		 547 aa  643    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.411178  normal  0.110788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0452  chaperonin GroEL  60.3 
 
 		 547 aa  635    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.992131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  63.16 
 
 		 539 aa  671    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 546 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  60.46 
 
 		 540 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 548 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0357  chaperonin GroEL  61.98 
 
 		 544 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3095  chaperonin GroEL  63.07 
 
 		 542 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  59.62 
 
 		 542 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0468  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 547 aa  636    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0739991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3397  chaperonin GroEL  60.46 
 
 		 545 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0555  chaperonin GroEL  60.46 
 
 		 545 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.22128  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0019  chaperonin GroEL  59.77 
 
 		 553 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.557028  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3660  chaperonin GroEL  60.5 
 
 		 545 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000280031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0604  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 551 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.390233  normal  0.0849194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  61.64 
 
 		 546 aa  657    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3124  chaperonin GroEL  60.84 
 
 		 545 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.549796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  60 
 
 		 540 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1863  chaperonin GroEL  62.21 
 
 		 550 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  61.45 
 
 		 546 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  60.46 
 
 		 540 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  62.69 
 
 		 543 aa  662    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2345  chaperonin GroEL  62.71 
 
 		 542 aa  658    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000515051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  61.25 
 
 		 545 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3567  chaperonin GroEL  60.46 
 
 		 545 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0280431  decreased coverage  0.00325194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>