More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1055 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1162 aa  2405  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  44.75 
 
 
1523 aa  400  1e-110  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  44.85 
 
 
1523 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 
785 aa  316  1e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.57 
 
 
1340 aa  259  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 
369 aa  215  4e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 
1268 aa  214  8e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  42.51 
 
 
1435 aa  199  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
414 aa  197  8e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 
457 aa  179  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  40.32 
 
 
1119 aa  172  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 
377 aa  172  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
646 aa  171  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
677 aa  162  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
421 aa  160  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3362  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 
673 aa  155  3e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
679 aa  151  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
657 aa  150  1e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 
624 aa  149  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
280 aa  147  8e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
640 aa  146  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
270 aa  145  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
385 aa  144  1e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
798 aa  143  2e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
616 aa  141  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 
1739 aa  137  2e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2528  methyltransferase FkbM  35.84 
 
 
738 aa  135  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  39.23 
 
 
219 aa  132  5e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
797 aa  131  9e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  37.39 
 
 
229 aa  129  2e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1423  methyltransferase FkbM family  34.36 
 
 
739 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  43.64 
 
 
216 aa  129  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
1077 aa  129  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
397 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  34.51 
 
 
700 aa  127  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  38.15 
 
 
228 aa  125  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  37.09 
 
 
362 aa  125  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1321  methyltransferase FkbM family  34.47 
 
 
741 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 
703 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
419 aa  125  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  30 
 
 
427 aa  124  1e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  36.84 
 
 
215 aa  124  1e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4188  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
644 aa  123  2e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
391 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.79 
 
 
2401 aa  122  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
754 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  37.36 
 
 
229 aa  122  4e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  36.78 
 
 
229 aa  122  5e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  35.63 
 
 
229 aa  122  5e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  35.63 
 
 
229 aa  121  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  35.06 
 
 
229 aa  121  8e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  35.63 
 
 
229 aa  121  8e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
396 aa  121  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
311 aa  120  1e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  32.27 
 
 
681 aa  120  1e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  35.06 
 
 
229 aa  120  1e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  35.06 
 
 
229 aa  120  1e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  35.06 
 
 
229 aa  120  1e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  38.2 
 
 
217 aa  120  1e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  35.06 
 
 
229 aa  120  1e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  32.05 
 
 
400 aa  120  1e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
525 aa  119  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
994 aa  118  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3361  hypothetical protein  34.59 
 
 
1049 aa  118  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
318 aa  118  7e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
1256 aa  118  8e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
312 aa  117  1e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
392 aa  117  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
1317 aa  117  2e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
826 aa  116  2e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
337 aa  114  7e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
391 aa  115  7e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
303 aa  114  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
1314 aa  114  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  39.31 
 
 
746 aa  114  1e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
633 aa  114  1e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  26.78 
 
 
585 aa  113  2e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  34.97 
 
 
199 aa  113  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  40 
 
 
581 aa  113  2e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
300 aa  112  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
308 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
392 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  30.38 
 
 
1444 aa  112  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  43.54 
 
 
996 aa  112  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
293 aa  112  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
1312 aa  111  7e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
400 aa  111  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
499 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
1106 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
294 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
557 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
1600 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
395 aa  110  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
311 aa  109  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
438 aa  109  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
824 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
313 aa  108  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
1287 aa  108  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  6.8759e-06 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  30.08 
 
 
434 aa  108  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
680 aa  108  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>