More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0238 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  100 
 
 		 87 aa  176  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0485  50S ribosomal protein L27  78.75 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229022  normal  0.0825407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 93 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  78.26 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  62.92 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  113  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3276  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212602 
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 88 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1526  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1583  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  58.43 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  63.64 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  64.44 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 87 aa  110  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  65.12 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  69.86 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  110  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 90 aa  110  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4511  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  58.89 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  60.67 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0892  50S ribosomal protein L27  70.27 
 
 		 85 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  71.23 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 90 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3140  50S ribosomal protein L27  70.51 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122142  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  69.57 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 83 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1005  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000876711  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  60.44 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  60.44 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  59.55 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 84 aa  107  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  63.86 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1572  50S ribosomal protein L27  68.92 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.355414  normal  0.759943 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1754  50S ribosomal protein L27  68.92 
 
 		 85 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.163114  normal  0.0575884 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  59.09 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  68.92 
 
 		 90 aa  105  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 89 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 87 aa  105  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  68.49 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  69.86 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  68.57 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>