41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3154 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3154  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 302 aa  624  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0588837  normal  0.0946962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2807  hypothetical protein  37.17 
 
 		 295 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00870169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5728  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.88 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.06 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.56 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.56 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  40.83 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.17 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.33 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2975  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.86 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.988163  normal  0.298504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.36 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  31.14 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.29 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.24 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.16 
 
 		 288 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  31.53 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_006686  CND00500  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.96 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  29.14 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08106  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.386049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.64 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09246  toxin biosynthesis proten (Fum3), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14710)  28.19 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  36.23 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  23.74 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  31.45 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.55 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  24.46 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.87 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09227  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00230)  24.59 
 
 		 416 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.32 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  21.91 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2304  phytanoyl-CoA dioxygenase  35.96 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.95 
 
 		 267 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.88 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  26.95 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.51 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  26.04 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.24 
 
 		 404 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.82 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>