56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3459 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  100 
 
 		 866 aa  1788    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2738  methyltransferase type 11  35.93 
 
 		 561 aa  330  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2530  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1656  hypothetical protein  31.87 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1839  hypothetical protein  32.24 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1319  hypothetical protein  27.04 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1421  hypothetical protein  27.47 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20311  hypothetical protein  32.21 
 
 		 295 aa  72.8  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 198 aa  72  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1185  hypothetical protein  26.67 
 
 		 658 aa  72  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0534773  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  27.39 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 238 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1667  hypothetical protein  29.27 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3067  hypothetical protein  30.25 
 
 		 384 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1274  hypothetical protein  29.8 
 
 		 658 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.367202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  32.97 
 
 		 668 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2385  hypothetical protein  29.63 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2301  hypothetical protein  30.06 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00584965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2275  hypothetical protein  30.06 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.969243  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2059  hypothetical protein  30.06 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.302728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2121  hypothetical protein  30.06 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.9714  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4232  hypothetical protein  28.48 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332018  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2055  hypothetical protein  30.06 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2307  hypothetical protein  30.06 
 
 		 379 aa  64.3  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2258  hypothetical protein  28.12 
 
 		 384 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  25.08 
 
 		 1082 aa  62.4  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2387  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.247097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1676  hypothetical protein  31.01 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.746938  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1678  hypothetical protein  30.08 
 
 		 281 aa  55.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00270694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  35.63 
 
 		 240 aa  55.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 415 aa  55.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2515  Methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 213 aa  54.3  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1204  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 223 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.19766  normal  0.871669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 254 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 235 aa  48.5  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.46 
 
 		 244 aa  48.5  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0141  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 227 aa  48.5  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  44 
 
 		 283 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3716  hypothetical protein  31.18 
 
 		 233 aa  48.1  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4237  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 311 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 242 aa  47.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0397  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 241 aa  47.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  29.91 
 
 		 239 aa  47.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2454  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 324 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.314737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  43.08 
 
 		 357 aa  46.2  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  35 
 
 		 238 aa  45.8  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 264 aa  45.8  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.62 
 
 		 248 aa  46.2  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4485  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.31 
 
 		 341 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0493356  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 1476 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 281 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  34.52 
 
 		 242 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 266 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  32.05 
 
 		 242 aa  44.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  47.73 
 
 		 255 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 203 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>