24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1676 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1676  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.746938  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1678  hypothetical protein  67.97 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00270694  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4232  hypothetical protein  42.75 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332018  normal  0.516222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1421  hypothetical protein  41.7 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2530  hypothetical protein  42.47 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.235135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1319  hypothetical protein  42.08 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0658553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1185  hypothetical protein  37.69 
 
 		 658 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0534773  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1274  hypothetical protein  38.1 
 
 		 658 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567725  normal  0.367202 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1839  hypothetical protein  36.14 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1656  hypothetical protein  37.71 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1007  hypothetical protein  32.92 
 
 		 500 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2307  hypothetical protein  32.7 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2055  hypothetical protein  32.95 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2059  hypothetical protein  32.95 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.302728  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1667  hypothetical protein  31.28 
 
 		 373 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2301  hypothetical protein  32.95 
 
 		 384 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00584965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2275  hypothetical protein  32.95 
 
 		 384 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.969243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2121  hypothetical protein  32.95 
 
 		 384 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.9714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2385  hypothetical protein  31.75 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3067  hypothetical protein  30.22 
 
 		 384 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2258  hypothetical protein  30.26 
 
 		 384 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3459  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 866 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0352711  normal  0.0439165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2738  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 561 aa  52  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>