More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2278 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 198 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  63.33 
 
 		 181 aa  235  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 		 182 aa  234  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  63.33 
 
 		 181 aa  234  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  61.88 
 
 		 183 aa  233  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  61.88 
 
 		 183 aa  233  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 		 197 aa  233  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  61.33 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 		 184 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 		 184 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 		 184 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 		 184 aa  232  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  61.33 
 
 		 183 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  61.88 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  61.33 
 
 		 181 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  59.67 
 
 		 181 aa  230  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 		 181 aa  230  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  61.33 
 
 		 183 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  61.49 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  228  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  59.12 
 
 		 182 aa  228  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  61.33 
 
 		 182 aa  228  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  60.22 
 
 		 181 aa  228  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  60.56 
 
 		 181 aa  227  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  61.49 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  60.22 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  61.45 
 
 		 183 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  59.32 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 		 178 aa  207  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 175 aa  206  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 181 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 		 174 aa  200  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 		 175 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  51.15 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 		 173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 173 aa  192  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 		 181 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 		 181 aa  190  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 171 aa  187  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 196 aa  185  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 		 170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 186 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 170 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 174 aa  177  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  45.9 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 171 aa  177  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 		 194 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>