132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0182 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  100 
 
 
502 aa  1033  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  36.67 
 
 
510 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  34.12 
 
 
505 aa  307  2e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  35.94 
 
 
529 aa  302  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  33.93 
 
 
505 aa  290  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  31.62 
 
 
495 aa  221  2e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  32.23 
 
 
500 aa  220  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  1.93925e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  30.08 
 
 
495 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  31.49 
 
 
500 aa  216  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  5.03049e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  30.35 
 
 
508 aa  216  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  29.86 
 
 
508 aa  214  4e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  29.41 
 
 
508 aa  213  5e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  29.47 
 
 
498 aa  213  8e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  29.41 
 
 
508 aa  213  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  30.62 
 
 
503 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  28.93 
 
 
503 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  31.43 
 
 
492 aa  208  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  29.96 
 
 
503 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  29.77 
 
 
503 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  35.28 
 
 
435 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  29.7 
 
 
494 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  30.75 
 
 
435 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  30.75 
 
 
435 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  30.75 
 
 
435 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.34146e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  30 
 
 
443 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  27.77 
 
 
501 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  35.94 
 
 
443 aa  180  5e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  29.79 
 
 
445 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  29.09 
 
 
443 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  37.59 
 
 
433 aa  171  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  36.01 
 
 
433 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  38.3 
 
 
433 aa  167  3e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  36.01 
 
 
433 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  37.94 
 
 
433 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  36.01 
 
 
433 aa  166  6e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  37.94 
 
 
433 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  37.94 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  36.01 
 
 
433 aa  166  1e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  37.94 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  37.94 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.01225e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  37.94 
 
 
433 aa  166  1e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.45512e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  36.01 
 
 
433 aa  165  2e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  37.59 
 
 
433 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  38.56 
 
 
495 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  37.76 
 
 
433 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  28.94 
 
 
535 aa  153  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  40.1 
 
 
321 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  36.43 
 
 
512 aa  141  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  36.43 
 
 
512 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  35.77 
 
 
512 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  27.79 
 
 
508 aa  130  5e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  39.13 
 
 
347 aa  129  9e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 
511 aa  129  1e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  27.72 
 
 
508 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  27.78 
 
 
510 aa  124  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.62 
 
 
519 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  37.39 
 
 
213 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  37.39 
 
 
213 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  37.39 
 
 
213 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  37.39 
 
 
213 aa  113  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  37.39 
 
 
213 aa  113  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.59 
 
 
513 aa  113  1e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  40.22 
 
 
215 aa  112  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  31.01 
 
 
499 aa  112  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.7 
 
 
511 aa  112  2e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  40.22 
 
 
215 aa  112  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  34.38 
 
 
315 aa  110  7e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  37.33 
 
 
213 aa  107  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  27.9 
 
 
487 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  35.15 
 
 
510 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  23.75 
 
 
490 aa  98.2  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.1 
 
 
505 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  31.43 
 
 
540 aa  97.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  29.8 
 
 
508 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  27.25 
 
 
514 aa  95.1  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  27.3 
 
 
505 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  25.12 
 
 
508 aa  93.6  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  25.94 
 
 
596 aa  93.2  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  35.51 
 
 
291 aa  91.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  38.07 
 
 
208 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  34.68 
 
 
211 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.96 
 
 
543 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  26.09 
 
 
494 aa  88.6  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  36.36 
 
 
208 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  36.36 
 
 
208 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  36.16 
 
 
208 aa  87.4  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  36.36 
 
 
208 aa  86.7  1e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  34.5 
 
 
511 aa  85.5  2e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  28.46 
 
 
321 aa  85.9  2e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  34.58 
 
 
208 aa  85.1  2e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  35.26 
 
 
207 aa  85.9  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  33.81 
 
 
206 aa  81.3  3e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  29.34 
 
 
519 aa  79.7  1e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0435  adenylate cyclase  33.64 
 
 
208 aa  78.2  4e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.38967  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0459  adenylate cyclase  33.64 
 
 
208 aa  77.8  4e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.211373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.36 
 
 
504 aa  77.8  5e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  27.79 
 
 
518 aa  77.4  6e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  29.86 
 
 
286 aa  77  8e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  29.22 
 
 
520 aa  76.3  1e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2864  adenylate cyclase  33.64 
 
 
208 aa  75.9  2e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39702  normal  0.988059 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>