More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0397 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  100 
 
 		 293 aa  591  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  57.29 
 
 		 297 aa  337  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  57.48 
 
 		 286 aa  315  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  55.1 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0184  ATP synthase, subunit gamma (H(+)-transporting two-sector ATPase)  54.76 
 
 		 295 aa  311  7.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  53.95 
 
 		 294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  53.42 
 
 		 294 aa  301  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.47 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.62 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.44 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  48.12 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1984  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.6 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0066  ATP synthase F1 subunit gamma  46.28 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  43.28 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.08 
 
 		 287 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0141  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.96 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.634729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0263  F0F1 ATP synthase subunit gamma  46.6 
 
 		 292 aa  258  7e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0182804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.34 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.73 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.37 
 
 		 287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.99 
 
 		 283 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.98 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.2 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.29 
 
 		 287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.08 
 
 		 288 aa  245  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.91 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  48.35 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.27 
 
 		 283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.8 
 
 		 290 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.84 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.1 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.84 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.36 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.55 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.14 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.82 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2194  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.46 
 
 		 291 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.19 
 
 		 298 aa  221  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.5 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2527  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00422  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.73 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002029  ATP synthase gamma chain  39.04 
 
 		 288 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.347667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.23 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4333  ATP synthase F1, gamma subunit  36.86 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00821812  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  38.41 
 
 		 287 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3060  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.8 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  37.54 
 
 		 295 aa  215  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.12 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.522997  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.39 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6063  ATP synthase F1, gamma subunit  38.96 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.38 
 
 		 286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.58 
 
 		 292 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  40.33 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  38.57 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.6 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 		 288 aa  209  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.99 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.08 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.7 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4241  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.597705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.7 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.46 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0602  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.16 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0313525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.18 
 
 		 285 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.99 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.38 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0202  ATP synthase F1, gamma subunit  38.49 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.92 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12060  ATP synthase, F1 gamma subunit  38.19 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.4 
 
 		 295 aa  205  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  38.7 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06105  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.24 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.12 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.01 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  37.8 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.49 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.67 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.67 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>