266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5361 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  100 
 
 
170 aa  344  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  85.8 
 
 
170 aa  300  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  84.62 
 
 
170 aa  293  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  77.91 
 
 
171 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  76.02 
 
 
171 aa  265  3e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  75.58 
 
 
171 aa  261  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5005  dihydrofolate reductase  75 
 
 
171 aa  260  7e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  69.82 
 
 
176 aa  252  2e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  71.34 
 
 
168 aa  235  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  64.85 
 
 
171 aa  228  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04580  dihydrofolate reductase  70.12 
 
 
168 aa  214  6e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  54.94 
 
 
172 aa  172  3e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  50 
 
 
195 aa  171  3e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  48.8 
 
 
164 aa  170  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
169 aa  169  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  55.48 
 
 
160 aa  168  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  51.88 
 
 
160 aa  168  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  52.73 
 
 
174 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 
160 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  53.7 
 
 
172 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  51.25 
 
 
160 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  55.56 
 
 
160 aa  165  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  2.43395e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  55.86 
 
 
160 aa  165  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  50.61 
 
 
167 aa  165  3e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  54.93 
 
 
160 aa  165  3e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  51.5 
 
 
169 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
160 aa  164  6e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  54.93 
 
 
160 aa  162  2e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  47.65 
 
 
171 aa  162  2e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  50.66 
 
 
160 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  47.62 
 
 
169 aa  161  4e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  54.23 
 
 
160 aa  160  5e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  54.23 
 
 
160 aa  160  8e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  54.23 
 
 
160 aa  160  8e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  53.52 
 
 
160 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  49.38 
 
 
167 aa  158  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
163 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  49.7 
 
 
165 aa  157  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
171 aa  157  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
166 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2025  dihydrofolate reductase  51.74 
 
 
173 aa  155  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.517984  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  48.5 
 
 
159 aa  156  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 
170 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  46.01 
 
 
172 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.71 
 
 
177 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
160 aa  152  3e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.8363e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 
159 aa  151  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
166 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  45.73 
 
 
172 aa  150  6e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 
162 aa  150  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 
161 aa  150  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  41.98 
 
 
161 aa  150  8e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
162 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.74022e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  46.39 
 
 
163 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
162 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  1.00648e-11 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  50.99 
 
 
166 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
166 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
162 aa  148  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
162 aa  148  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
162 aa  148  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
162 aa  148  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
163 aa  148  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
162 aa  148  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
162 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
162 aa  148  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
162 aa  148  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.30652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 
167 aa  147  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  50.33 
 
 
166 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 
187 aa  147  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 
171 aa  146  1e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  43.64 
 
 
161 aa  146  1e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.86123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
167 aa  145  2e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  43.48 
 
 
161 aa  145  2e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  45.45 
 
 
166 aa  145  2e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 
160 aa  145  2e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  48.78 
 
 
219 aa  145  2e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  45.78 
 
 
162 aa  145  2e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 
162 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 
166 aa  145  4e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
160 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
160 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
160 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
167 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0700  dihydrofolate reductase region  45.91 
 
 
163 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.694361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  48.17 
 
 
167 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  48.21 
 
 
160 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
175 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  46.95 
 
 
166 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
166 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 
188 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
167 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  46.11 
 
 
165 aa  141  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
167 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1420  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
178 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>