More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4075 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4075  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
370 aa  742    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000427384  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23290  histidinol-phosphate aminotransferase  80.6 
 
 
369 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.113747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  79.89 
 
 
369 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1964  histidinol-phosphate aminotransferase  78.69 
 
 
369 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15840  histidinol-phosphate aminotransferase  76.09 
 
 
370 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1024  histidinol-phosphate aminotransferase  62.5 
 
 
374 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  61.39 
 
 
373 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1684  histidinol-phosphate aminotransferase  59.17 
 
 
369 aa  421  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  58.31 
 
 
370 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1417  histidinol-phosphate aminotransferase  59.67 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3038  histidinol-phosphate aminotransferase  62.15 
 
 
365 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  55 
 
 
392 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  55.37 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  51.24 
 
 
369 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1208  histidinol-phosphate aminotransferase  56.37 
 
 
385 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342464  normal  0.0473532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0927  histidinol-phosphate aminotransferase  58.31 
 
 
379 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0775  histidinol-phosphate aminotransferase  56.67 
 
 
374 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00278497 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1194  histidinol-phosphate aminotransferase  53.2 
 
 
373 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  56.98 
 
 
374 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0562865 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  54.87 
 
 
370 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0905  histidinol-phosphate aminotransferase  56.5 
 
 
374 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2574  histidinol-phosphate aminotransferase  56.98 
 
 
376 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.62978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0567  histidinol-phosphate aminotransferase  55.61 
 
 
381 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1335  histidinol-phosphate aminotransferase  57.41 
 
 
394 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.687157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  54.6 
 
 
370 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0742  histidinol-phosphate aminotransferase  54.04 
 
 
371 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0952  histidinol-phosphate aminotransferase  58.01 
 
 
384 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.221365  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1312  histidinol-phosphate aminotransferase  53.57 
 
 
374 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000790606 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0496  histidinol-phosphate aminotransferase  53.44 
 
 
374 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1233  histidinol-phosphate aminotransferase  56.06 
 
 
362 aa  362  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0717  histidinol-phosphate aminotransferase  56.15 
 
 
374 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0898  histidinol-phosphate aminotransferase  51.77 
 
 
365 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.907335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1020  histidinol-phosphate aminotransferase  51.77 
 
 
365 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.874382  unclonable  0.0000000000413694 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2138  histidinol-phosphate aminotransferase  51.38 
 
 
363 aa  338  8e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.180028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  48.09 
 
 
367 aa  335  7.999999999999999e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  47.89 
 
 
362 aa  334  2e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  48.89 
 
 
380 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  47.65 
 
 
386 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  47.96 
 
 
380 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  44.85 
 
 
370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  44.23 
 
 
358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1594  histidinol-phosphate aminotransferase  49.17 
 
 
365 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121928 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2116  histidinol-phosphate aminotransferase  44.13 
 
 
388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  unclonable  0.00000966557 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  43.53 
 
 
374 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  41.01 
 
 
372 aa  292  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1184  histidinol-phosphate aminotransferase  45.28 
 
 
362 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1155  histidinol-phosphate aminotransferase  44.69 
 
 
363 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  45.6 
 
 
364 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2137  histidinol-phosphate aminotransferase  44.03 
 
 
365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1681  histidinol-phosphate aminotransferase  40.62 
 
 
370 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1645  histidinol-phosphate aminotransferase  40.34 
 
 
370 aa  278  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1442  histidinol-phosphate aminotransferase  40.34 
 
 
370 aa  277  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1400  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
370 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.563984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1428  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
370 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1400  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
370 aa  276  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1539  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
370 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1612  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
370 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219277 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  43.66 
 
 
383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  39.04 
 
 
373 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4299  aminotransferase  46.63 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0482  histidinol-phosphate aminotransferase  45.17 
 
 
365 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1241  histidinol-phosphate aminotransferase  39.66 
 
 
370 aa  269  7e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  40.87 
 
 
369 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  40.6 
 
 
369 aa  262  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9607  histidinol-phosphate aminotransferase  40.11 
 
 
368 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  38.63 
 
 
365 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  37.26 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2282  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
366 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  38.29 
 
 
365 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1574  histidinol-phosphate aminotransferase  40.62 
 
 
370 aa  253  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0926  histidinol-phosphate aminotransferase  36.63 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0893821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  37.81 
 
 
365 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3273  histidinol-phosphate aminotransferase  41.51 
 
 
377 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3771  histidinol-phosphate aminotransferase  40.06 
 
 
370 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  42.39 
 
 
375 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.207883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5257  histidinol-phosphate aminotransferase  40.49 
 
 
370 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0312345  normal  0.0211103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  36.71 
 
 
365 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0307  histidinol-phosphate aminotransferase  39.28 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2958  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 
366 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3580  histidinol-phosphate aminotransferase  38.74 
 
 
369 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2996  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 
366 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3873  histidinol-phosphate aminotransferase  38.74 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0584274 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3084  histidinol-phosphate aminotransferase  38.19 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  37.43 
 
 
389 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1987  histidinol-phosphate aminotransferase  40.33 
 
 
365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1912  histidinol-phosphate aminotransferase  40.33 
 
 
368 aa  243  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1593  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
372 aa  242  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366496  normal  0.0868494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0583  histidinol-phosphate aminotransferase  37.26 
 
 
365 aa  242  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0471  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 
364 aa  242  7e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  43.33 
 
 
362 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0674  histidinol-phosphate aminotransferase  37.81 
 
 
365 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1646  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
372 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0217  histidinol-phosphate aminotransferase  38.16 
 
 
366 aa  239  5e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2696  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
366 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1874  histidinol-phosphate aminotransferase  39.5 
 
 
372 aa  238  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.0493927 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3002  histidinol-phosphate aminotransferase  36.29 
 
 
366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0113319  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  37.36 
 
 
383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2379  histidinol phosphate aminotransferase  37.81 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.279952 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  36 
 
 
366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0331892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>