131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2643 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  892    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  66.92 
 
 		 407 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  66.08 
 
 		 402 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  56.94 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  54.72 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  52.72 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  51.3 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  45.79 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  44.34 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  39.29 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  34.54 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 956 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 535 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  26.68 
 
 		 1340 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 994 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  32.96 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 456 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  24.8 
 
 		 1119 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.54 
 
 		 860 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  29.08 
 
 		 700 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 		 703 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 274 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 499 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 902 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 1106 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  26.25 
 
 		 537 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  31.65 
 
 		 442 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 1156 aa  94.4  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 691 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  26.25 
 
 		 537 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 691 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 691 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 824 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  27.33 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  26.7 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  30.86 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 683 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  26.22 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  28.4 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 		 1152 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  23.79 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 892 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  33.02 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  23.46 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  29.14 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  27.74 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  27.27 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  28.02 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  27.78 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.25 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 		 1075 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  31.45 
 
 		 1837 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  26.62 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  28.65 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>