59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0307 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  100 
 
 		 271 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  52.4 
 
 		 265 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  41.13 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  48.47 
 
 		 785 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  49.12 
 
 		 879 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  51.87 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  46.26 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  46.26 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  46.46 
 
 		 447 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  43.14 
 
 		 409 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  46.7 
 
 		 459 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  46.26 
 
 		 456 aa  199  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  44.44 
 
 		 477 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  38.28 
 
 		 320 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  43.35 
 
 		 444 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  44.44 
 
 		 1644 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  44.44 
 
 		 1644 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  38.29 
 
 		 314 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  34.94 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  32.39 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  33.33 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  31.74 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  31.71 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  31.06 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  32.04 
 
 		 569 aa  72  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2368  hypothetical protein  44 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1207  hypothetical protein  30.05 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  27.65 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  27.01 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  24.87 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  26.42 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0376  FkbM family methyltransferase  26.6 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0408  methyltransferase FkbM family  26.6 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0444  methyltransferase FkbM family  27.66 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  32.88 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  26.62 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  23.37 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  24.24 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0706  FkbM family methyltransferase  27.51 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0495964 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  27.81 
 
 		 784 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  26.35 
 
 		 351 aa  49.3  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7663  methyltransferase FkbM family  27.57 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1267  methyltransferase FkbM family  25.99 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  29.41 
 
 		 579 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  24.47 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3954  FkbM family methyltransferase  28.33 
 
 		 221 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  26.71 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  26.71 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3719  methyltransferase FkbM  28.08 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4793  methyltransferase FkbM family  26.92 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.018486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4554  FkbM family methyltransferase  28.83 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.02089  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2335  methyltransferase FkbM  25.16 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2896  FkbM family methyltransferase  25.19 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2279  methyltransferase FkbM family  27.85 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0263  methyltransferase FkbM family  28.86 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2673  methyltransferase FkbM family  30.28 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6950  FkbM family methyltransferase  27.57 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  24.21 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1079  FkbM family methyltransferase  28.47 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301839  normal  0.843879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>