More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3523 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  100 
 
 
465 aa  966  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  47.11 
 
 
467 aa  461  1e-128  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  41.86 
 
 
469 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  42.79 
 
 
451 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  41.94 
 
 
469 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  42.46 
 
 
478 aa  373  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  41.91 
 
 
468 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  8.64556e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  41.77 
 
 
446 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  42.18 
 
 
470 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  41.28 
 
 
478 aa  360  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  38.31 
 
 
471 aa  359  7e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  40.56 
 
 
464 aa  353  3e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  42.22 
 
 
458 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  41.89 
 
 
444 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  40.47 
 
 
478 aa  343  3e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  37.9 
 
 
478 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  40.09 
 
 
452 aa  337  2e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  39.14 
 
 
450 aa  337  2e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  39.1 
 
 
470 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  39.08 
 
 
438 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  37.28 
 
 
474 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  39.39 
 
 
478 aa  328  9e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  41.21 
 
 
482 aa  327  2e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  37.88 
 
 
463 aa  327  4e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  38.43 
 
 
475 aa  327  4e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  38.74 
 
 
446 aa  326  4e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  38.31 
 
 
453 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  38.83 
 
 
446 aa  326  6e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  40.72 
 
 
448 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  36.4 
 
 
461 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  5.85051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  39.31 
 
 
472 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  38.17 
 
 
479 aa  321  2e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  39.51 
 
 
472 aa  320  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  39.22 
 
 
478 aa  320  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1789  6-phospho-beta-galactosidase  40.34 
 
 
470 aa  320  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2220  6-phospho-beta-galactosidase  40.8 
 
 
470 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2259  6-phospho-beta-galactosidase  40.8 
 
 
470 aa  319  6e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  37.23 
 
 
439 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  36.56 
 
 
462 aa  318  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  38.33 
 
 
452 aa  316  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  38.71 
 
 
467 aa  315  8e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  40.22 
 
 
443 aa  315  1e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  40 
 
 
450 aa  313  5e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  37.63 
 
 
446 aa  310  3e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3603  TonB-like  38.06 
 
 
461 aa  309  7e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.70293  hitchhiker  0.00573623 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  37.18 
 
 
487 aa  308  2e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  39.48 
 
 
459 aa  308  2e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  39.31 
 
 
448 aa  306  5e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  37.66 
 
 
468 aa  305  9e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  37.55 
 
 
461 aa  305  1e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  38.01 
 
 
482 aa  305  1e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  37.66 
 
 
467 aa  305  1e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  37.98 
 
 
484 aa  304  2e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  37.82 
 
 
500 aa  305  2e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  37.29 
 
 
456 aa  304  2e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  36.13 
 
 
476 aa  304  3e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3481  glycoside hydrolase family 1  37.23 
 
 
470 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  37.23 
 
 
462 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  37.92 
 
 
458 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  35.84 
 
 
460 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  38.19 
 
 
456 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  35.62 
 
 
460 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  35.41 
 
 
460 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  35.7 
 
 
465 aa  300  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  35.7 
 
 
470 aa  299  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  35.41 
 
 
460 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  37.2 
 
 
461 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  36.44 
 
 
455 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  39.7 
 
 
453 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  35.19 
 
 
460 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  37.47 
 
 
485 aa  297  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  35.52 
 
 
499 aa  296  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  36.66 
 
 
447 aa  296  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  38.54 
 
 
909 aa  295  9e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  37.58 
 
 
484 aa  295  9e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  2.15907e-05  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  35.64 
 
 
465 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  36.48 
 
 
439 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  36.98 
 
 
463 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  35.43 
 
 
450 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  38.55 
 
 
436 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  36.21 
 
 
474 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  38.38 
 
 
472 aa  294  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  34.55 
 
 
459 aa  293  6e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  37.61 
 
 
466 aa  292  7e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  37.72 
 
 
458 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  37.15 
 
 
474 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  36.56 
 
 
458 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  35.64 
 
 
488 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  35.99 
 
 
470 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  36.73 
 
 
455 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  36.98 
 
 
463 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  37.55 
 
 
458 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  36.34 
 
 
448 aa  290  5e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  34.25 
 
 
460 aa  289  9e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  36.14 
 
 
445 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  37.42 
 
 
457 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  36.74 
 
 
467 aa  287  3e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  34.27 
 
 
468 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  36.53 
 
 
470 aa  286  6e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  36.93 
 
 
457 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>