131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0817 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0817  CreA family protein  100 
 
 		 153 aa  312  9e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2014  CreA family protein  70.21 
 
 		 151 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2505  CreA family protein  70.92 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1167  CreA family protein  70.92 
 
 		 150 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.538794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3321  CreA family protein  60.81 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2864  hypothetical protein  66.41 
 
 		 162 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2837  CreA family protein  62.22 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542639  hitchhiker  0.00948652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2576  CreA family protein  63.08 
 
 		 164 aa  183  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.474356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1763  CreA family protein  60.28 
 
 		 165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1414  hypothetical protein  58.16 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0931733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1370  hypothetical protein  58.16 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602896  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2047  CreA family protein  58.99 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  normal  0.359349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1836  CreA family protein  39.19 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1788  CreA family protein  40.4 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.804701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2655  CreA family protein  39.86 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.546871  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1872  CreA family protein  39.19 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2453  CreA family protein  39.19 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1735  CreA family protein  42.64 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1824  CreA family protein  41.86 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00367873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2282  CreA family protein  40.28 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2098  CreA  39.29 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.409089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2205  CreA family protein  40.28 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2415  CreA family protein  39.58 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2190  creA protein  41.86 
 
 		 165 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  36.84 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46347  predicted protein  38.85 
 
 		 255 aa  99  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.048303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2009  creA protein  41.09 
 
 		 164 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1975  CreA family protein  35.42 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00187565  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2403  CreA family protein  37.33 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000790127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  38.22 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0829  CreA family protein  38.76 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  0.0737603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  43.88 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  43.88 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0434  creA protein  41.88 
 
 		 160 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  43.88 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  43.88 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  38.26 
 
 		 167 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  43.88 
 
 		 162 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  36.73 
 
 		 178 aa  90.9  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0588  putative lipoprotein  37.19 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.253081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  43.17 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  37.01 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  41.61 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000206  CreA protein  38.97 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.665354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03125  creA protein  36.36 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  41.94 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3273  CreA  37.5 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  35.29 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  39.73 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  39.83 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  41.13 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  38.06 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  37.32 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  38.06 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  38.06 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  40.14 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  35 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  36.55 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  38 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  38.1 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  37.58 
 
 		 161 aa  84  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  39.01 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  34.55 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  36.67 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  37.16 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  37.16 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1436  creA protein  40.17 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  35.71 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  37.16 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  33.33 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  35.37 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  35.37 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  37.78 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  33.12 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  37.23 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  34.11 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  35.88 
 
 		 179 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  34.72 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  34.72 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  35.66 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  34.72 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  34.72 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  34.72 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  36.49 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  41.3 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  39.2 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  34.29 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  36.36 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  38.21 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  39.32 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>