132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0434 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0434  creA protein  100 
 
 
160 aa  330  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3273  CreA  77.85 
 
 
154 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000206  CreA protein  80.45 
 
 
156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.665354  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0588  putative lipoprotein  72.19 
 
 
158 aa  232  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.253081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2403  CreA family protein  75.52 
 
 
155 aa  230  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000790127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1436  creA protein  79.02 
 
 
159 aa  224  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0829  CreA family protein  67.97 
 
 
164 aa  221  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.272971  normal  0.0737603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03125  creA protein  74.64 
 
 
170 aa  218  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05941  hypothetical protein  76.03 
 
 
157 aa  213  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  67.63 
 
 
164 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1975  CreA family protein  62.91 
 
 
165 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00187565  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2009  creA protein  64.63 
 
 
164 aa  189  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1788  CreA family protein  62.5 
 
 
165 aa  184  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.804701  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2655  CreA family protein  60.67 
 
 
166 aa  184  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.546871  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2415  CreA family protein  63.77 
 
 
171 aa  184  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113844  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1735  CreA family protein  58.5 
 
 
162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2190  creA protein  63.04 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2205  CreA family protein  63.97 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2282  CreA family protein  58.06 
 
 
171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84118  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2098  CreA  60.28 
 
 
161 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.409089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2453  CreA family protein  57.14 
 
 
162 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1824  CreA family protein  57.53 
 
 
162 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00367873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1872  CreA family protein  57.14 
 
 
162 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1836  CreA family protein  56.46 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3321  CreA family protein  46.21 
 
 
151 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2014  CreA family protein  40.14 
 
 
151 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418182  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2505  CreA family protein  42.54 
 
 
186 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1167  CreA family protein  42.22 
 
 
150 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.538794  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2047  CreA family protein  42.94 
 
 
165 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  normal  0.359349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1763  CreA family protein  42.95 
 
 
165 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2837  CreA family protein  38.85 
 
 
164 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542639  hitchhiker  0.00948652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2576  CreA family protein  38.85 
 
 
164 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.474356  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1414  hypothetical protein  38.93 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0931733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1370  hypothetical protein  38.93 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2864  hypothetical protein  41.03 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0817  CreA family protein  41.88 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  44.74 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  46.61 
 
 
170 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  39.22 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  38.75 
 
 
166 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  40.46 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  44.07 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  44.07 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  41.18 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  39.07 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  42.61 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  40.87 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  42.61 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  42.61 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  36.77 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  42.61 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  42.06 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  40.87 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  37.11 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  40.87 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  40.87 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  40.71 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  36.42 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  40.68 
 
 
184 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  40.68 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  40.68 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  42.2 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  36.23 
 
 
164 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  40.5 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  39.13 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  36.44 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  39.13 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  35.82 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  40.37 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  38.89 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  42.11 
 
 
180 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  38.81 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  40.74 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  40.74 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  41.3 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  40.52 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  40.74 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  34.19 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  33.97 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  37.93 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  37.93 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  36.88 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  36.13 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  38.53 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  33.81 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  33.81 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  33.81 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  35.26 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  33.81 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  33.81 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>