132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1471 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  100 
 
 		 169 aa  345  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  85.99 
 
 		 159 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  92.75 
 
 		 159 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  70.32 
 
 		 160 aa  231  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  72.54 
 
 		 159 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  72.54 
 
 		 159 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  72.54 
 
 		 159 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  72.54 
 
 		 159 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  72.54 
 
 		 159 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  70.59 
 
 		 157 aa  228  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  71.14 
 
 		 158 aa  227  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  71.83 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  71.83 
 
 		 159 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  70.67 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  74.81 
 
 		 161 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  73.91 
 
 		 160 aa  222  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  74.81 
 
 		 161 aa  221  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  74.07 
 
 		 161 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  74.07 
 
 		 161 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  74.07 
 
 		 161 aa  220  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  72.66 
 
 		 158 aa  217  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  70.83 
 
 		 167 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  71.32 
 
 		 158 aa  213  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  64.9 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  66.19 
 
 		 167 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  60.9 
 
 		 163 aa  191  5e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  64.75 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  65.44 
 
 		 168 aa  187  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  64.71 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  63.97 
 
 		 168 aa  184  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  63.04 
 
 		 169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  61.15 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  61.97 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  62.04 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  60.69 
 
 		 156 aa  177  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  58.9 
 
 		 153 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  57.34 
 
 		 153 aa  173  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  56.64 
 
 		 153 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  55.03 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  63.78 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  62.02 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  56.55 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  62.99 
 
 		 154 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  62.12 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  59.85 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  53.85 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  56.76 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  52.9 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  56.43 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  56.43 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  56.43 
 
 		 155 aa  158  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  56.12 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  58.52 
 
 		 162 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  58.52 
 
 		 162 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  58.52 
 
 		 157 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  58.52 
 
 		 157 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  52.56 
 
 		 160 aa  157  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  58.52 
 
 		 162 aa  157  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.820567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  58.96 
 
 		 157 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  53.9 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  50.65 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  52.52 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  46.36 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  45.62 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  50.35 
 
 		 170 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  52.8 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  50 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  51.97 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  51.2 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  53.28 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  47.5 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  52.46 
 
 		 182 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  47.17 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  50.41 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  45.28 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  47.33 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  51.26 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  47.68 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  46.98 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  43.85 
 
 		 179 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  43.24 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  39.87 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  41.78 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5614  CreA family protein  33.57 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0817  CreA family protein  35 
 
 		 153 aa  85.1  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2837  CreA family protein  37.97 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542639  hitchhiker  0.00948652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2009  creA protein  36.67 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2576  CreA family protein  37.42 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.474356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0065  creA protein, putative  32.41 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1146  CreA family protein  33.85 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1763  CreA family protein  36.13 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1414  hypothetical protein  36.18 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0931733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>