132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1237 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  73.51 
 
 
161 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  59.03 
 
 
155 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  51.94 
 
 
155 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  47.13 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  51.02 
 
 
154 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  151  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  49.31 
 
 
153 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  46.2 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  49.64 
 
 
153 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  48.63 
 
 
160 aa  149  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  49.32 
 
 
153 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  48.65 
 
 
153 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  51.85 
 
 
169 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  46.21 
 
 
157 aa  144  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  44.97 
 
 
156 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  46.31 
 
 
155 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  51.88 
 
 
172 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  46.31 
 
 
155 aa  144  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  46.31 
 
 
155 aa  144  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  50 
 
 
162 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  47.22 
 
 
156 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  48.84 
 
 
168 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  49.61 
 
 
154 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  47.55 
 
 
158 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  50.39 
 
 
168 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  50.39 
 
 
168 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  49.6 
 
 
168 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  45.03 
 
 
156 aa  140  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  47.26 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  47.79 
 
 
157 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  43.95 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  46.97 
 
 
178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  47.29 
 
 
154 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  49.61 
 
 
152 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  47.29 
 
 
154 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  50.39 
 
 
167 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  45.52 
 
 
157 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  44.97 
 
 
159 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  49.24 
 
 
160 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  45.67 
 
 
150 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  46.36 
 
 
161 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  48.03 
 
 
161 aa  131  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  46.46 
 
 
161 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  46.46 
 
 
161 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  46.46 
 
 
161 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  47.62 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  44.44 
 
 
156 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  46.46 
 
 
161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  45.89 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  47.06 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  47.06 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  47.06 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  47.06 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  47.06 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  45.26 
 
 
167 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  42.07 
 
 
159 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  41.33 
 
 
170 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  43.26 
 
 
181 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  42.28 
 
 
169 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  46.32 
 
 
159 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  46.32 
 
 
159 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  44.7 
 
 
159 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  39.74 
 
 
184 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  43.08 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  39.73 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  44.22 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  39.22 
 
 
176 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  36.97 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  38.61 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  46.34 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  43.65 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  43.09 
 
 
183 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  39.33 
 
 
180 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  43.09 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  43.09 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  41.46 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  40.65 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  35.8 
 
 
187 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1763  CreA family protein  45.27 
 
 
165 aa  104  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1414  hypothetical protein  41.89 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0931733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1370  hypothetical protein  41.89 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  42.86 
 
 
164 aa  97.4  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3321  CreA family protein  38.03 
 
 
151 aa  94.4  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2098  CreA  41.29 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.409089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1788  CreA family protein  46.09 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.804701  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1975  CreA family protein  38.85 
 
 
165 aa  90.9  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00187565  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2655  CreA family protein  41.61 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.546871  normal  0.237745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>