132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0634 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  100 
 
 
168 aa  342  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  99.4 
 
 
168 aa  340  7e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  87.86 
 
 
178 aa  257  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  87.5 
 
 
168 aa  257  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  74.26 
 
 
168 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  73.24 
 
 
169 aa  220  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  65.38 
 
 
157 aa  218  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  69.44 
 
 
167 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  66.67 
 
 
158 aa  217  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  63.25 
 
 
163 aa  214  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  69.72 
 
 
172 aa  214  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  66.45 
 
 
157 aa  207  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  64.74 
 
 
160 aa  203  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  67.63 
 
 
160 aa  200  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  67.65 
 
 
161 aa  198  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  66.67 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  66.67 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  66.67 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  66.67 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  66.67 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  65.96 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  65.96 
 
 
159 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  66.18 
 
 
161 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  66.18 
 
 
161 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  66.18 
 
 
161 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  66.18 
 
 
161 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  66.18 
 
 
161 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  59.88 
 
 
169 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  66.19 
 
 
167 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  58.86 
 
 
159 aa  191  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  61.64 
 
 
153 aa  190  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  60.96 
 
 
153 aa  190  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  62.68 
 
 
153 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  63.31 
 
 
159 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  62.86 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  60.54 
 
 
153 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  66.41 
 
 
154 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  66.14 
 
 
152 aa  184  5e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  63.04 
 
 
158 aa  184  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  65.35 
 
 
154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  65.35 
 
 
154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  63.16 
 
 
156 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  59.6 
 
 
156 aa  181  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  60 
 
 
156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  64.57 
 
 
150 aa  181  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  55.63 
 
 
155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  55.63 
 
 
155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  55.63 
 
 
155 aa  181  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  54.36 
 
 
161 aa  180  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  53.69 
 
 
154 aa  177  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  52.23 
 
 
159 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  57.45 
 
 
158 aa  174  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  60.74 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  60.74 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  60.74 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  53.38 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  60.74 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  60.74 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  61.19 
 
 
157 aa  171  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  55.32 
 
 
164 aa  170  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  54.25 
 
 
156 aa  167  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  50.92 
 
 
160 aa  166  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  54.33 
 
 
155 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  51.75 
 
 
155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  50 
 
 
179 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  50.7 
 
 
170 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  48.91 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  44.81 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  46 
 
 
161 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  45.99 
 
 
184 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  45.65 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  42.14 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  45.93 
 
 
182 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  43.18 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  38.71 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  40.94 
 
 
183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  43.36 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  43.92 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  42.42 
 
 
182 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  44.17 
 
 
182 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  39.1 
 
 
187 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  41.72 
 
 
155 aa  120  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  40.27 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1763  CreA family protein  39.1 
 
 
165 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3321  CreA family protein  42 
 
 
151 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2576  CreA family protein  42 
 
 
164 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.474356  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2837  CreA family protein  42 
 
 
164 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.542639  hitchhiker  0.00948652 
 
 
-
 
NC_004310  BR1414  hypothetical protein  39.33 
 
 
165 aa  97.4  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0931733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1370  hypothetical protein  39.33 
 
 
165 aa  97.4  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602896  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2014  CreA family protein  39.1 
 
 
151 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418182  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  43.48 
 
 
164 aa  94.7  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2505  CreA family protein  38.46 
 
 
186 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>