132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3479 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  317  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  317  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  317  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  83.87 
 
 
159 aa  277  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  80 
 
 
156 aa  260  6e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  84.25 
 
 
160 aa  258  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  78.06 
 
 
158 aa  253  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  82.31 
 
 
160 aa  253  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  84.06 
 
 
162 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  84.06 
 
 
162 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  84.06 
 
 
162 aa  253  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  84.06 
 
 
157 aa  253  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  84.06 
 
 
157 aa  253  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  84.67 
 
 
157 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  75 
 
 
161 aa  248  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  61.74 
 
 
156 aa  200  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  66.42 
 
 
154 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  63.01 
 
 
153 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  66.42 
 
 
154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  64.03 
 
 
153 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  59.87 
 
 
156 aa  197  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  64.03 
 
 
153 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  61.64 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  65.19 
 
 
154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  65.67 
 
 
152 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  63.31 
 
 
164 aa  193  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  64.23 
 
 
154 aa  189  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  62.69 
 
 
150 aa  188  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  60.87 
 
 
169 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  59.72 
 
 
167 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  54.3 
 
 
157 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  58.96 
 
 
155 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  55.15 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  58.82 
 
 
160 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  54.48 
 
 
172 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  57.25 
 
 
168 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  57.25 
 
 
168 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  55.19 
 
 
158 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  54.42 
 
 
157 aa  168  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  55.73 
 
 
168 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  56.49 
 
 
168 aa  167  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  58.33 
 
 
156 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  52.78 
 
 
160 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  59.4 
 
 
161 aa  163  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  59.4 
 
 
161 aa  163  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  59.4 
 
 
161 aa  163  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  58.65 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  56.3 
 
 
163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  58.65 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  58.65 
 
 
161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  55.47 
 
 
159 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  55.47 
 
 
159 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  55.47 
 
 
159 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  55.47 
 
 
159 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  55.47 
 
 
159 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  55 
 
 
167 aa  161  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  57.04 
 
 
158 aa  160  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  56.43 
 
 
169 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  54.74 
 
 
159 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  54.74 
 
 
159 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  58.21 
 
 
159 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  58.21 
 
 
159 aa  156  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  56.3 
 
 
158 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  48.99 
 
 
155 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  50 
 
 
180 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  47.62 
 
 
181 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  45.95 
 
 
173 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  48 
 
 
166 aa  146  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  51.02 
 
 
161 aa  146  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  47.8 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  46.26 
 
 
184 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  46.15 
 
 
184 aa  144  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  45.86 
 
 
187 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  48.82 
 
 
182 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  48.53 
 
 
179 aa  141  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  43.87 
 
 
186 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  48.82 
 
 
182 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  48.03 
 
 
182 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  47.71 
 
 
183 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  48.82 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  45.7 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  48.03 
 
 
183 aa  135  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  41.83 
 
 
155 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1763  CreA family protein  41.06 
 
 
165 aa  101  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1414  hypothetical protein  41.06 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0931733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1370  hypothetical protein  41.06 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2655  CreA family protein  38.19 
 
 
166 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.546871  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  37.18 
 
 
164 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2190  creA protein  42.61 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3321  CreA family protein  37.41 
 
 
151 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1788  CreA family protein  36.84 
 
 
165 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.804701  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2014  CreA family protein  35.48 
 
 
151 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>