132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2934 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2934  CreA family protein  100 
 
 
158 aa  321  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134682  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1050  hypothetical protein  92.41 
 
 
158 aa  273  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013058  normal  0.385913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1693  creA protein  74.19 
 
 
160 aa  239  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320611  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0619  CreA  84.44 
 
 
161 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000154449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1098  CreA family protein  84.44 
 
 
161 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2205  CreA family protein  74.38 
 
 
160 aa  238  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571035  normal  0.349002 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1057  CreA family protein  84.44 
 
 
161 aa  238  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000059839  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4211  hypothetical protein  83.7 
 
 
161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728234  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0806  CreA family protein  78.47 
 
 
167 aa  237  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.327606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4041  CreA  72.55 
 
 
157 aa  236  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2776  creA protein  79.14 
 
 
159 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1829  CreA protein  79.14 
 
 
159 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0978  CreA family protein  82.22 
 
 
161 aa  236  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590297  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0974  CreA family protein  82.22 
 
 
161 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0506  creA protein  78.42 
 
 
159 aa  234  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405365  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2935  CreA protein  78.42 
 
 
159 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000238483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2506  creA protein  78.42 
 
 
159 aa  234  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020214  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2818  CreA protein  78.42 
 
 
159 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000698436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2878  CreA protein  78.42 
 
 
159 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00867181  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4747  hypothetical protein  72.61 
 
 
158 aa  233  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.199706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1471  putative CREA signal peptide protein  67.09 
 
 
169 aa  221  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  0.156186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1356  CreA family protein  62.89 
 
 
159 aa  214  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.389056  normal  0.0606126 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1420  CreA family protein  66.67 
 
 
159 aa  208  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136825  normal  0.374337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0655  CreA family protein  64.71 
 
 
168 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0634  CreA family protein  63.97 
 
 
168 aa  184  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4988  CreA family protein  62.14 
 
 
178 aa  183  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109414  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2219  CreA family protein  63.97 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.733419  normal  0.0172674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1715  CreA  59.12 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.842807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3982  CreA family protein  62.04 
 
 
168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2794  CreA protein  58 
 
 
157 aa  179  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.610019  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1790  CreA family protein  58.99 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0692  CreA family protein  57.14 
 
 
153 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0724  CreA family protein  57.14 
 
 
153 aa  173  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.0462373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5711  CreA family protein  59.42 
 
 
169 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4493  CreA family protein  59.29 
 
 
153 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.105025  normal  0.313164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2016  CreA family protein  60.29 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.894625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0724  CreA family protein  59.29 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0705  CreA  57.53 
 
 
156 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60410  hypothetical protein  61.36 
 
 
154 aa  167  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5204  hypothetical protein  61.42 
 
 
154 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4856  CreA  59.84 
 
 
154 aa  166  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40750  CreA family protein  60.31 
 
 
150 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0801  creA protein  55.48 
 
 
156 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2475  CreA family protein  53.69 
 
 
154 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227158  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3678  CreA family protein  58.78 
 
 
152 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3479  hypothetical protein  53.69 
 
 
155 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3672  hypothetical protein  52.2 
 
 
160 aa  157  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0812  hypothetical protein  53.69 
 
 
155 aa  157  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3607  hypothetical protein  53.69 
 
 
155 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04273  hypothetical protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3600  CreA family protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5912  hypothetical protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4633  hypothetical protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4996  hypothetical protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3659  hypothetical protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4948  hypothetical protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04238  hypothetical protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4945  hypothetical protein  57.97 
 
 
157 aa  157  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0530  hypothetical protein  55.7 
 
 
158 aa  156  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0569  hypothetical protein  52.56 
 
 
161 aa  155  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0680  hypothetical protein  56.83 
 
 
159 aa  155  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000479478  normal  0.515655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0326  CreA  52.05 
 
 
156 aa  154  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.884281  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0558  hypothetical protein  54.42 
 
 
156 aa  153  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4945  hypothetical protein  56.93 
 
 
157 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4911  hypothetical protein  56.93 
 
 
157 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3866  hypothetical protein  54.29 
 
 
160 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000248157  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4997  hypothetical protein  56.93 
 
 
162 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.820567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4999  hypothetical protein  56.93 
 
 
162 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4838  hypothetical protein  56.93 
 
 
162 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0789  CreA family protein  55.64 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000658156  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5289  CreA family protein  52.8 
 
 
181 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205432  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2083  CreA  50.39 
 
 
155 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5214  CreA family protein  51.2 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.304465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4747  CreA family protein  51.2 
 
 
184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00543414  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5569  CreA family protein  45.95 
 
 
170 aa  133  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1905  CreA  45.03 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0457  CreA family protein  45.28 
 
 
166 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.931999  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1640  CreA family protein  44.44 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3447  CreA family protein  48.36 
 
 
182 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2379  CreA family protein  46.83 
 
 
161 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248608  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2345  CreA  47.41 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00745568  normal  0.221071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2105  CreA  47.5 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1237  CreA family protein  43.08 
 
 
179 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.074293 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1583  CreA  43.8 
 
 
186 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38703  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4719  CreA family protein  44.52 
 
 
183 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0777837  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2502  CreA  43.9 
 
 
182 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0026  CreA family protein  40.14 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2941  CreA  42.98 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.518009  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3882  hypothetical protein  44.54 
 
 
183 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.391331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0133  CreA family protein  41.72 
 
 
176 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3676  CreA family protein  41.32 
 
 
180 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000448514  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5614  CreA family protein  36.57 
 
 
159 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.299882  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1836  CreA family protein  37.75 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1735  CreA family protein  37.75 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1824  CreA family protein  37.09 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00367873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2453  CreA family protein  37.09 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1872  CreA family protein  37.09 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.210491  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2009  creA protein  40.54 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2522  CreA family protein  39.26 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2014  CreA family protein  37.58 
 
 
151 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.418182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>