68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2416 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2416  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  178  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2096  hypothetical protein  82.56 
 
 
86 aa  152  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00698872  normal  0.744231 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  69.77 
 
 
91 aa  122  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  41.76 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  41.76 
 
 
101 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  45.83 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  41.18 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  41.76 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  40.86 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  41.76 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  41.76 
 
 
102 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  40.66 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  40.66 
 
 
101 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  51.72 
 
 
103 aa  67  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  40.66 
 
 
102 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  41.18 
 
 
103 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  44.44 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  44.44 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3660  hypothetical protein  47.06 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299487  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2880  hypothetical protein  46.55 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244519  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  48.33 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1267  hypothetical protein  46.58 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000298758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  48.33 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  46.55 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  52.94 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03215  Fe-S protein-like proteinEB3  43.94 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000030181  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02667  hypothetical protein  46.55 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  45 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  45 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  45 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  45 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2802  hypothetical protein  48.98 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00781596  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3354  hypothetical protein  43.1 
 
 
106 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  39.71 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  43.1 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  43.4 
 
 
81 aa  58.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.46 
 
 
60 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  43.64 
 
 
76 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  38.6 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  29.73 
 
 
285 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  42.22 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  41.86 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  39.58 
 
 
250 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  37.78 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  36.07 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  37.74 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  35.71 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  39.53 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5057  hypothetical protein  37.21 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226542  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1363  hypothetical protein  31.37 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  36 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  37.21 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  40.74 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  35.29 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  34.48 
 
 
73 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  33.96 
 
 
76 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  37.21 
 
 
61 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  37.21 
 
 
61 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  27.87 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  29.63 
 
 
267 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>