More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2365 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 526 aa  1092    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  46.97 
 
 		 517 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  47.62 
 
 		 529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  47.78 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  45.35 
 
 		 528 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  45.18 
 
 		 533 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  51.48 
 
 		 565 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0332  N-6 DNA methylase  49.66 
 
 		 709 aa  432  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  44.58 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  44.58 
 
 		 495 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  39.78 
 
 		 538 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  40.46 
 
 		 662 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3910  N-6 DNA methylase  49.28 
 
 		 356 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  41.29 
 
 		 694 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  34.44 
 
 		 538 aa  314  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2469  N-6 DNA methylase  39.19 
 
 		 772 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  36.17 
 
 		 519 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  34.98 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  34.98 
 
 		 514 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  35.37 
 
 		 515 aa  297  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  33.91 
 
 		 503 aa  296  6e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  34.73 
 
 		 501 aa  296  8e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  34.08 
 
 		 529 aa  295  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  34.14 
 
 		 529 aa  295  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  34.13 
 
 		 521 aa  293  5e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  34.54 
 
 		 501 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  34.24 
 
 		 517 aa  292  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.84 
 
 		 497 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  34.24 
 
 		 540 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  33.65 
 
 		 510 aa  287  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  33.89 
 
 		 525 aa  286  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  33.89 
 
 		 525 aa  286  7e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  34 
 
 		 544 aa  286  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  35.09 
 
 		 541 aa  286  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  35.05 
 
 		 500 aa  286  9e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  34.27 
 
 		 520 aa  283  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  33.9 
 
 		 527 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  34.12 
 
 		 527 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  33.77 
 
 		 523 aa  279  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  34.38 
 
 		 540 aa  279  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  34.14 
 
 		 518 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.72 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  32.9 
 
 		 535 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 518 aa  276  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  33.15 
 
 		 511 aa  276  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  32.71 
 
 		 517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.46 
 
 		 544 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  32.67 
 
 		 540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  33.39 
 
 		 539 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  32.09 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  33.03 
 
 		 540 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  32.96 
 
 		 519 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  32.59 
 
 		 576 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  30.46 
 
 		 564 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  34.07 
 
 		 543 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  31.51 
 
 		 528 aa  260  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.18 
 
 		 548 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  30.86 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  30.45 
 
 		 567 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  30.02 
 
 		 570 aa  246  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  31.14 
 
 		 510 aa  239  9e-62  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  29.5 
 
 		 569 aa  237  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  29.82 
 
 		 544 aa  236  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  29.36 
 
 		 568 aa  226  7e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  29.5 
 
 		 537 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.3 
 
 		 574 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  32.05 
 
 		 849 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.64 
 
 		 587 aa  200  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  32.62 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  28.83 
 
 		 574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  27.47 
 
 		 495 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  29.03 
 
 		 505 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  28.42 
 
 		 585 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  28.86 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.86 
 
 		 633 aa  180  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 504 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.68 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  30.9 
 
 		 815 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.79 
 
 		 523 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.79 
 
 		 508 aa  176  9e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  28.08 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0826  type I restriction-modification system, M subunit  26.34 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.580356  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0964  N-6 DNA methylase  26.34 
 
 		 520 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.311438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  26.47 
 
 		 814 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  28.74 
 
 		 516 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  27.27 
 
 		 499 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  26.52 
 
 		 808 aa  168  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0306  N-6 DNA methylase  25.13 
 
 		 547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  26.73 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  26.46 
 
 		 511 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  27.36 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.68 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  28.02 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0333  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 547 aa  161  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175232 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 809 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1159  N-6 DNA methylase  25.49 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000301602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  25.6 
 
 		 501 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  27.65 
 
 		 873 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>