More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1782 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  99.69 
 
 
441 aa  675  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  99.69 
 
 
497 aa  672  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  99.69 
 
 
327 aa  671  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  100 
 
 
325 aa  674  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  100 
 
 
325 aa  675  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  99.69 
 
 
325 aa  672  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  99.38 
 
 
329 aa  672  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  99.69 
 
 
333 aa  672  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  99.38 
 
 
325 aa  672  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  81.79 
 
 
325 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  81.79 
 
 
325 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  8.45152e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  58.66 
 
 
329 aa  394  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  58.72 
 
 
333 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  58.59 
 
 
321 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  58.41 
 
 
463 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  58.41 
 
 
321 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  56.79 
 
 
323 aa  359  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  56.31 
 
 
323 aa  356  2e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  55.69 
 
 
323 aa  353  3e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  56.52 
 
 
323 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2447  integrase catalytic subunit  57.65 
 
 
238 aa  244  2e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  67.46 
 
 
179 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  57.92 
 
 
216 aa  218  8e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  57.92 
 
 
216 aa  218  8e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  38.44 
 
 
321 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0733  transposase, putative  49.77 
 
 
229 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 
316 aa  179  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 
316 aa  179  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  37.74 
 
 
323 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
316 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
316 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
316 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
316 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  37.25 
 
 
314 aa  172  5e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  2.79647e-10 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  36.84 
 
 
329 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  37.28 
 
 
327 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  36.84 
 
 
329 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  37.28 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  37.28 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  36.84 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  37.28 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  37.28 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  37.28 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  37.28 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  37.28 
 
 
316 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  35.56 
 
 
320 aa  170  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  33.53 
 
 
330 aa  168  9e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  34.43 
 
 
330 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  34.43 
 
 
330 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  34.43 
 
 
330 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  38.33 
 
 
274 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  34.04 
 
 
321 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  37.81 
 
 
284 aa  167  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  33.14 
 
 
330 aa  167  3e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  36.69 
 
 
314 aa  167  3e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  34.06 
 
 
320 aa  166  4e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  34.13 
 
 
348 aa  164  1e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  34.13 
 
 
355 aa  164  2e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  37.15 
 
 
319 aa  162  5e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  37.15 
 
 
319 aa  162  5e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  37.15 
 
 
319 aa  162  5e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  37.15 
 
 
319 aa  162  5e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  34.31 
 
 
463 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  40.43 
 
 
288 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  33.99 
 
 
343 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  33.99 
 
 
332 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  39.15 
 
 
284 aa  156  5e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  36.08 
 
 
293 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  34.24 
 
 
330 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  38.43 
 
 
288 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  36.93 
 
 
288 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3105  hypothetical protein  38.87 
 
 
290 aa  153  3e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  38.72 
 
 
336 aa  152  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  39.39 
 
 
302 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  38.96 
 
 
289 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  38.89 
 
 
289 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  36.63 
 
 
265 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  38.46 
 
 
289 aa  149  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  37.45 
 
 
289 aa  148  1e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  37.45 
 
 
289 aa  148  1e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  37.45 
 
 
289 aa  148  1e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  37.87 
 
 
289 aa  147  2e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  35.98 
 
 
289 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  35.78 
 
 
303 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  36.44 
 
 
272 aa  137  3e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  32.97 
 
 
277 aa  135  7e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  34.42 
 
 
259 aa  134  2e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  34.5 
 
 
286 aa  134  2e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  34.5 
 
 
329 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1683  hypothetical protein  36.33 
 
 
275 aa  132  7e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  38.12 
 
 
206 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  36.36 
 
 
221 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  32.61 
 
 
280 aa  109  8e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1518  hypothetical protein  54.26 
 
 
101 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2980  hypothetical protein  27.76 
 
 
274 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653613  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  37.11 
 
 
188 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  37.21 
 
 
178 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  38.16 
 
 
157 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  28.8 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  27.51 
 
 
316 aa  83.6  5e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>