92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1518 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2980  hypothetical protein  58.14 
 
 		 274 aa  98.6  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653613  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  57.75 
 
 		 327 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  57.75 
 
 		 441 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  57.75 
 
 		 325 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  57.75 
 
 		 333 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  57.75 
 
 		 329 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  57.75 
 
 		 325 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  57.75 
 
 		 325 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  57.75 
 
 		 325 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  57.75 
 
 		 497 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  53.95 
 
 		 325 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  53.95 
 
 		 325 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1631  Integrase catalytic region  46.88 
 
 		 329 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2626  transcriptional regulator, putative  45.05 
 
 		 336 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2732  transcriptional regulator, putative  44.94 
 
 		 289 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1371  Fis family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0199142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2839  transcriptional regulator, putative  44.94 
 
 		 289 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2665  transcriptional regulator, putative  44.94 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1603  transcriptional regulator, putative  43.82 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1327  transcriptional regulator, putative  43.82 
 
 		 289 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2928  transcriptional regulator, putative  42.7 
 
 		 289 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1426  transcriptional regulator, putative  42.7 
 
 		 289 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1420  transcriptional regulator, putative  42.7 
 
 		 289 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1424  transcriptional regulator, putative  44.94 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1454  transcriptional regulator, putative  42.7 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0697104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3201  transcriptional regulator, putative  42.7 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1222  transcriptional regulator, putative  42.7 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2906  transcriptional regulator, putative  43.82 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  46.05 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  46.05 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  46.05 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1116  transcriptional regulator, putative  44.44 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2664  transcriptional regulator, putative  41.57 
 
 		 284 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3105  hypothetical protein  48.57 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.674192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  46.05 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8690  putative integrase  37.65 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1683  hypothetical protein  45.83 
 
 		 275 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0793  putative integrase  38.82 
 
 		 343 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.638394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0021  putative integrase  38.82 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5037  Integrase catalytic region  37.65 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  37.65 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00518  transposase  39.47 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01280  transposase  39.47 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0995831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  39.47 
 
 		 323 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2535  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 323 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1401  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1424  integrase catalytic subunit  36.84 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  36.46 
 
 		 321 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  40.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  37 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2557  integrase, catalytic region  38.54 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.805017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  38 
 
 		 316 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  38 
 
 		 316 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  38 
 
 		 316 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  38 
 
 		 316 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  38 
 
 		 329 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  38 
 
 		 316 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  38 
 
 		 316 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  38 
 
 		 316 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  38 
 
 		 327 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  38 
 
 		 316 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  38 
 
 		 329 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  36.84 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  38.2 
 
 		 463 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  35.79 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3474  hypothetical protein  34.74 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.180544 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  36.9 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  36.9 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  36.9 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  36.9 
 
 		 319 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  41.54 
 
 		 330 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0122  integrase, catalytic region  35.96 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1515  integrase catalytic region  32 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  32.29 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  32.29 
 
 		 320 aa  48.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  35.42 
 
 		 265 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0799  hypothetical protein  41.07 
 
 		 373 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  31.25 
 
 		 284 aa  47  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  33.33 
 
 		 320 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7134  Integrase catalytic core  32.56 
 
 		 303 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>