More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0092 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  66.01 
 
 
306 aa  414  1e-115  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.08382e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  63.82 
 
 
304 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.25089e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  63.49 
 
 
304 aa  411  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.96344e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  64.47 
 
 
304 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  63.49 
 
 
304 aa  408  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  62.17 
 
 
304 aa  401  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.76339e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  60.98 
 
 
305 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  60.07 
 
 
304 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  55.67 
 
 
306 aa  351  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  55.81 
 
 
304 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  55.03 
 
 
307 aa  342  3e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  55.15 
 
 
306 aa  338  5e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.67 
 
 
302 aa  336  2e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.39 
 
 
306 aa  330  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  51.51 
 
 
301 aa  329  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  52.32 
 
 
304 aa  327  2e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  54.03 
 
 
303 aa  324  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.66 
 
 
304 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  53.82 
 
 
302 aa  322  5e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.33 
 
 
303 aa  318  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.36 
 
 
298 aa  315  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  52.49 
 
 
302 aa  314  1e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.97 
 
 
298 aa  311  6e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  52.16 
 
 
302 aa  310  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.28992e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.83 
 
 
304 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  52 
 
 
307 aa  307  1e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.67 
 
 
303 aa  305  8e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.5 
 
 
324 aa  300  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.63 
 
 
308 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  48.21 
 
 
334 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3491  quinolinate synthetase  48.2 
 
 
334 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  48.2 
 
 
334 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  47.54 
 
 
334 aa  283  2e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.01 
 
 
332 aa  283  3e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.35 
 
 
303 aa  281  7e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  45.07 
 
 
322 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  45.93 
 
 
308 aa  279  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  44.9 
 
 
301 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  45.83 
 
 
318 aa  275  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  48.52 
 
 
331 aa  273  2e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  46 
 
 
311 aa  273  2e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
321 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  44.22 
 
 
301 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.73 
 
 
323 aa  272  5e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  8.30693e-06  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  43.23 
 
 
323 aa  270  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.44 
 
 
331 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  42.76 
 
 
304 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  42.67 
 
 
312 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0361  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.83 
 
 
295 aa  263  4e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
318 aa  262  5e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  44 
 
 
310 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2557  quinolinate synthetase  46.78 
 
 
324 aa  261  7e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445713  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
328 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2424  quinolinate synthetase  46.76 
 
 
327 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.52 
 
 
320 aa  260  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2819  quinolinate synthetase  47.44 
 
 
327 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.433128  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  43.71 
 
 
333 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.81 
 
 
334 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4338  quinolinate synthetase  46.05 
 
 
370 aa  259  5e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.230361  normal  0.0900103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4757  quinolinate synthetase  45.73 
 
 
307 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  0.37432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  44.55 
 
 
328 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  42.09 
 
 
304 aa  258  7e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5463  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.93 
 
 
338 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222387  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.24 
 
 
333 aa  257  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  44 
 
 
323 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  41.75 
 
 
304 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.16 
 
 
330 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0699  quinolinate synthetase  44.67 
 
 
359 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363533  normal  0.866465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.22 
 
 
338 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  43.14 
 
 
322 aa  256  4e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0295  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.12 
 
 
345 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4591  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.1 
 
 
333 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0791  quinolinate synthetase  45.15 
 
 
369 aa  256  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897217 
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  44.63 
 
 
308 aa  256  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2202  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
330 aa  255  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.189573  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  42.67 
 
 
308 aa  254  9e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  40.4 
 
 
304 aa  254  1e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  42.57 
 
 
323 aa  254  1e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1107  quinolinate synthetase  45.02 
 
 
370 aa  253  2e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  42.91 
 
 
325 aa  253  4e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  42.91 
 
 
325 aa  252  4e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.23 
 
 
317 aa  252  5e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3494  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.39 
 
 
343 aa  252  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499841  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0922  quinolinate synthetase  45.08 
 
 
323 aa  252  6e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.642254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  42.35 
 
 
324 aa  250  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0734  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.82 
 
 
358 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.08 
 
 
346 aa  250  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1434  quinolinate synthetase  43.99 
 
 
343 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.582213  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.67 
 
 
310 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2215  quinolinate synthetase  45.73 
 
 
323 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.224036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3459  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.57 
 
 
462 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2870  quinolinate synthetase complex, A subunit  44 
 
 
357 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.725936  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  42.33 
 
 
323 aa  248  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2644  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.33 
 
 
347 aa  248  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.614387  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4432  quinolinate synthetase  42.81 
 
 
350 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558643  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2767  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.92 
 
 
357 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0866463  normal  0.426331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1229  quinolinate synthetase  44.67 
 
 
370 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  43.79 
 
 
348 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  42.91 
 
 
324 aa  247  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>