80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1790 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  70.59 
 
 		 221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  70.59 
 
 		 221 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  75.11 
 
 		 221 aa  299  2e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  48.15 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  46.07 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  47.83 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  43.23 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  43.82 
 
 		 213 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  28.93 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  27.8 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  34.55 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  30.29 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  31.54 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  28.49 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  30.17 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  29.74 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  32.26 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  28.5 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  32.3 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  31.76 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  30.97 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  29.88 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  29.35 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  32.21 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  29.57 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  27.54 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  24.49 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  26.98 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  33.56 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  34.59 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  26.47 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  28.76 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  34.09 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  26.71 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  30.07 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.2 
 
 		 797 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  30.15 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  29.25 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  29.93 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  31.67 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  29.41 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1883  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.7 
 
 		 806 aa  48.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 		 814 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  25.6 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1453  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 		 814 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  26.75 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2854  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 812 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.440462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.23 
 
 		 816 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.23 
 
 		 815 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  34.86 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 809 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.52188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1480  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 		 809 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.85 
 
 		 806 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1875  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 		 813 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4611  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.23 
 
 		 815 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16834  normal  0.0519802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0998  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 		 809 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1774  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 		 809 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.35718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1457  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 		 809 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1165  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.42 
 
 		 815 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.827312  normal  0.855752 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2590  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 810 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1553  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.52 
 
 		 810 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003705  phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain  28.85 
 
 		 801 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.374236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0148461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  25.16 
 
 		 789 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 821 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102742 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1630  hypothetical protein  31.68 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1740  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.218671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1091  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.39692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0968  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1534  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.540635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1896  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.35 
 
 		 810 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.963354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1364  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 809 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 809 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3476  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  25.37 
 
 		 812 aa  42  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000701468  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2751  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 811 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0848577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  25.74 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  25.74 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0844  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.13 
 
 		 795 aa  41.6  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>