136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1316 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  100 
 
 
214 aa  430  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2186  TenA family transcription regulator  66.99 
 
 
212 aa  287  9e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  65.07 
 
 
212 aa  278  4e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  64.11 
 
 
212 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  34.95 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  35.02 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  35.94 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  35.85 
 
 
220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  31.48 
 
 
231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  36.82 
 
 
226 aa  118  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  34.26 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  32.02 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  34.56 
 
 
227 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  30.56 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  31.48 
 
 
221 aa  115  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  30.88 
 
 
222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  30.56 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  30.56 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  30.56 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  30.56 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  30.56 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  30.56 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  30.23 
 
 
231 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  30.09 
 
 
231 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  36.74 
 
 
224 aa  111  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  32.09 
 
 
229 aa  111  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  32.09 
 
 
229 aa  111  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  32.09 
 
 
229 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  32.09 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  32.09 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  32.09 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  32.09 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  32.09 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  32.09 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  32.09 
 
 
229 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  31.48 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  31.43 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  30.48 
 
 
232 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  31.94 
 
 
218 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  31.05 
 
 
221 aa  105  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  32.87 
 
 
217 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  32.02 
 
 
243 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  33.67 
 
 
230 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  29.56 
 
 
230 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  30.73 
 
 
216 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  32.11 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  30.05 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0025  transcriptional activator, TenA family  29.38 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  30.88 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  30.88 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  30.88 
 
 
229 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  27.44 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7784  transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 
219 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  30.41 
 
 
216 aa  91.3  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  29.44 
 
 
219 aa  88.2  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  29.44 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0139  TenA family transcription regulator  28.78 
 
 
223 aa  87  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.743065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4918  transcriptional activator, TenA family  31 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  30.58 
 
 
510 aa  85.9  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2169  transcriptional activator, TenA family  25.46 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0044  TenA family transcriptional activator  30.92 
 
 
205 aa  84.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  31.03 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  30.32 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  28.64 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  30.37 
 
 
207 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1094  TenA family transcriptional activator  30.73 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.331158  hitchhiker  0.000493191 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  29.38 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1950  transcriptional regulator  28.84 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  24.77 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  28.87 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  33.55 
 
 
494 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  26.82 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  29.11 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  29.33 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  26.03 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0858  TENA/THI-4 protein  28.9 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  26.36 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  26.36 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  26.03 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4968  transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.0204405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  28.64 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70077  Phosphomethylpyrimidine kinase THI21 (HMP-phosphate kinase) (HMP-P kinase)  27.85 
 
 
583 aa  74.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.583202  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4454  TENA/THI-4 domain-containing protein  31.5 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.592634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  26.42 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0021  TenA family transcription regulator  32.12 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  29.9 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  28.43 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  28.05 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  29.15 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  26.94 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  28.92 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0123  putative transcriptional activator, TenA family  29.63 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  28.29 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34896  predicted protein  26.73 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2986  transcriptional activator, TenA family  31.13 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1931  transcriptional activator, TenA family  28.76 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  28.37 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  28.57 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  29.63 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>