257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0115 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  729    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  50.58 
 
 		 355 aa  315  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  53.2 
 
 		 362 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  49.85 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  54.49 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  54.49 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  54.49 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  52.68 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  49.86 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  49.86 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  49.86 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  49.86 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  49.86 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  52.68 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  52.68 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  52.68 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  52.68 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  52.68 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  52.68 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  52.68 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  52.68 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  49.29 
 
 		 348 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  49.39 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  46.3 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  51.63 
 
 		 359 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  47.55 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  47.65 
 
 		 359 aa  278  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  46.36 
 
 		 340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  51.53 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  51.53 
 
 		 355 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  43.3 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  52.04 
 
 		 361 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  45.31 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  41.39 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  45.42 
 
 		 338 aa  242  9e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  41.27 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  48.9 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  48.9 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  40.59 
 
 		 353 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  39.12 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  39.12 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  41.18 
 
 		 353 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  39.12 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  40.18 
 
 		 358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  40.42 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  38.62 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  40.29 
 
 		 355 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  40.82 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  40.29 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  40.47 
 
 		 355 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  46.18 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  41.19 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  39.77 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  39.77 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  39.77 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  39.77 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  40.53 
 
 		 329 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2283  hypothetical protein  39.1 
 
 		 362 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  37.04 
 
 		 343 aa  203  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0264  hypothetical protein  38.81 
 
 		 347 aa  203  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  38.82 
 
 		 420 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  39.82 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  42.86 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  43.73 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2241  hypothetical protein  40.12 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1432  hypothetical protein  38.64 
 
 		 342 aa  184  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1079  hypothetical protein  35.14 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1017  hypothetical protein  35.14 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0028722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  37.61 
 
 		 355 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  35.47 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  35.47 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  36.91 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0954  hypothetical protein  36.26 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.006029  normal  0.0131459 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  36.88 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1111  hypothetical protein  37.82 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00425236  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  34.3 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  34.83 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1051  hypothetical protein  35.76 
 
 		 367 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00435413  normal  0.0767092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  33.98 
 
 		 348 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  36.3 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  30.47 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  29.38 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.08 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  31.21 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.28 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  29.55 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  31.65 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  30.46 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  29.67 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.6 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30.66 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  32.38 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  33.02 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  37.38 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  31.01 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  30.47 
 
 		 342 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  29.28 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  30.06 
 
 		 335 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>