More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0113 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
189 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  55.87 
 
 
187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  55.49 
 
 
185 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  50.54 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  48.37 
 
 
195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  50 
 
 
186 aa  190  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  51.15 
 
 
181 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  50.81 
 
 
190 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  50.29 
 
 
192 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  49.12 
 
 
186 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  49.14 
 
 
204 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
189 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  45.81 
 
 
184 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  48.02 
 
 
188 aa  168  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  45.4 
 
 
182 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  44.83 
 
 
182 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  44.75 
 
 
192 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  45.95 
 
 
190 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  47.19 
 
 
189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  43.58 
 
 
189 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  43.89 
 
 
189 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  46.75 
 
 
181 aa  160  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  41.81 
 
 
178 aa  160  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  44.81 
 
 
196 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  45.36 
 
 
196 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  42.93 
 
 
195 aa  158  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  46.07 
 
 
189 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  45.88 
 
 
185 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  46.51 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 
180 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  41.21 
 
 
188 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  43.6 
 
 
177 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 
146 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
187 aa  148  6e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  44.57 
 
 
188 aa  147  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  43.5 
 
 
183 aa  144  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  41.57 
 
 
182 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
188 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  45.14 
 
 
186 aa  141  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  36.46 
 
 
184 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
180 aa  125  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
180 aa  125  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
318 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
296 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  44.59 
 
 
170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  42.02 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
176 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
189 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
189 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
188 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
192 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
185 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
178 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
285 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
170 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
165 aa  91.7  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
165 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  36.49 
 
 
165 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.85 
 
 
185 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
165 aa  89  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  32.89 
 
 
171 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
185 aa  87  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  38.17 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2299  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
166 aa  84.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  29.63 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.87 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  33.33 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  29.81 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  36.84 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.21 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  28.09 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>