More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1811 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  74.05 
 
 		 131 aa  204  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  72.87 
 
 		 129 aa  200  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  71.32 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  68.22 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  72.09 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2354  30S ribosomal protein S9  67.44 
 
 		 129 aa  167  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0958602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 128 aa  154  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  59.84 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  137  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  59.35 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 136 aa  133  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  55.28 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  55.65 
 
 		 171 aa  124  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 131 aa  123  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  51.91 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  51.91 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 167 aa  123  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  49.22 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  52.85 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 135 aa  120  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  52.42 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>