29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04730 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  100 
 
 		 312 aa  643    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  92.22 
 
 		 270 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  31.92 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  29.52 
 
 		 820 aa  89.4  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  25 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  24.39 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  24.55 
 
 		 535 aa  65.9  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  25.81 
 
 		 789 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  25.11 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  25.73 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  26.34 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  25.21 
 
 		 1242 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  23.33 
 
 		 395 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  26.99 
 
 		 934 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  27.33 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  30.58 
 
 		 1332 aa  53.1  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  27.33 
 
 		 255 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  26.21 
 
 		 487 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  22.39 
 
 		 599 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  23.93 
 
 		 1628 aa  50.1  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  25.12 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  23.05 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  24.08 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  24.08 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  33.93 
 
 		 712 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  48.57 
 
 		 753 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  41.67 
 
 		 640 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  23.83 
 
 		 494 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  31.07 
 
 		 718 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>