More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03511 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  100 
 
 
243 aa  503  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03985  transposase (IS4 family)  97.18 
 
 
213 aa  427  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  81.48 
 
 
268 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  81.48 
 
 
268 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  81.48 
 
 
268 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  81.48 
 
 
268 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  81.48 
 
 
268 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  80.66 
 
 
281 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  78.19 
 
 
268 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  75.11 
 
 
270 aa  384  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  63.98 
 
 
269 aa  321  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  58.05 
 
 
265 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  58.05 
 
 
265 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  58.05 
 
 
265 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  58.05 
 
 
265 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  56.96 
 
 
269 aa  278  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6839  transposase IS4 family protein  62.21 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  38.21 
 
 
308 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  34.2 
 
 
268 aa  143  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  39.07 
 
 
276 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  34.85 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  34.85 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  34.85 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  35.32 
 
 
274 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  35.32 
 
 
274 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  35.32 
 
 
274 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  38.14 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  36.32 
 
 
278 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  35.32 
 
 
274 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  35.32 
 
 
274 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  35.93 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  35.93 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  35.93 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  35.93 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  35.93 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  35.93 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  35.93 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  35.93 
 
 
270 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  34.89 
 
 
274 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  34.02 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  34.47 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  35.32 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  36.28 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  33.46 
 
 
294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  34.33 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  35.81 
 
 
284 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  35.81 
 
 
284 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  34.21 
 
 
253 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  35.37 
 
 
279 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  35.89 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  33.76 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  32.92 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  34.93 
 
 
287 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  34.93 
 
 
287 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  34.93 
 
 
287 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  33.48 
 
 
273 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  33.48 
 
 
273 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 
266 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  34.76 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>